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原创 gseGO分析流程

GSEA输入数据需要将gene根据log2FoldChange值从大到小的顺序以此排列，这时我们在R语言中导入数据的时候处理好就可以了。准备好输入文件，输入文件为差异表达分析结果，分析结果主要主要的是gene_ID，和log2foldchange这两列，如图红框框住部分。5.可视化所有富集结果，并显示上下调通路情况，这里的演示数据只使用了部分数据，所以不全。4，可视化其中通路情况，如GO:0000165，GO:0043408这两个通路。3,运行GSEGo程序,这里不将BP CC MF分开。