Matplotlib-OSError: [Errno 122] Disk quota exceeded when importing

在远程server运行python脚本调用scanpy时，其内部调用了matplotlib，此时发生报错如下:

...

File "～/miniconda3/envs/scanpy/lib/python3.8/site-packages/matplotlib/font_manager.py", line 961, in json_dump

_log.warning('Could not save font_manager cache {}'.format(e))

OSError: [Errno 122] Disk quota exceeded

  ...
    File "～/miniconda3/envs/scanpy/lib/python3.8/site-packages/matplotlib/font_manager.py", line 961, in json_dump
    _log.warning('Could not save font_manager cache {}'.format(e))
OSError: [Errno 122] Disk quota exceeded

此类报错已经在matplotlib的issue页面上反映过，已经解决。

此为developer的直接回复，另外issue提出者把cache_dir软连接到了空间充足的目录也解决了问题。

我没有找到其具体做法，使用了另外一种解决方案：

直接在python脚本的起始位置加上如下代码，重新设定configs的生成位置

import os
os.environ['MPLCONFIGDIR'] = os.getcwd() + "/configs/"
import matplotlib.pyplot as plt

然后重新运行即可，未见该报错。

python cbs_nametest.py --loom_file sdata.loom --raw_matrix ./exp --output_dir ./report

参考文章：

[Bug]: import failure when disk quota exceeded #22986

failure on import due to IOError writing font cache #9548

https://blog.csdn.net/Thanours/article/details/123370635