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宁远x
宁静致远,宁高宁远。
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nnUnet肾脏肿瘤分割实战(KiTS19)
nnUnet肾脏肿瘤分割实战KiTS19 Challenge Homepagennunet项目官方地址MIC-DKFZ/nnUNet 使用nnunet之前,建议先阅读两篇论文nnU-Net: Self-adapting Framework for U-Net-Based Medical Image SegmentationnnU-Net: a self-configuring method for deep learning-based biomedical image segmentation原创 2022-05-05 19:51:55 · 9747 阅读 · 25 评论 -
nn-UNet使用记录--开箱即用
nn-UNet使用记录–开箱即用nnunet项目官方地址MIC-DKFZ/nnUNet (github.com)使用nnunet之前,建议先阅读两篇论文nnU-Net: Self-adapting Framework for U-Net-Based Medical Image SegmentationnnU-Net: a self-configuring method for deep learning-based biomedical image segmentation本文使用vscode原创 2022-04-28 11:01:18 · 7012 阅读 · 28 评论 -
nnUnet代码解读--数据增强
nnunet项目官方地址MIC-DKFZ/nnUNet 准备工作关于nnUnet代码包的安装和配置参考[nn-UNet使用记录–代码配置_宁眸的博客-CSDN博客](nnUnet最经典的部分在于数据处理,本文简单介绍nnUnet的数据读取和数据增强方法。以nnunet/training/network_training/nnUNetTrainer.py为例数据读取self.dl_tr, self.dl_val = self.get_basic_generators()self.dl_t原创 2022-05-03 19:37:23 · 6209 阅读 · 4 评论 -
nn-UNet使用记录--代码配置
nnunet代码使用上一篇博文中,我在第三方的超算平台上配置了nnunet包,上手简单,但调参非常有限,也不能使用自己的模型。本文我将在实验室的服务器配置nnunet代码包(也是怕以后用不了第三方的平台了),可以直接阅读和修改源码,我认为是非常有必要的。1.服务器环境import torchprint(torch.__version__) # torch版本查询print(torch.version.cuda) # cuda版本查询print(torch.backends.cudnn.ve原创 2022-04-28 16:17:08 · 6207 阅读 · 12 评论 -
nnUnet代码解读--优化策略
优化策略nnUNetTrainerdef initialize_optimizer_and_scheduler(self): assert self.network is not None, "self.initialize_network must be called first" self.optimizer = torch.optim.Adam(self.network.parameters(), self.initial_lr, weight_decay=self.weight_原创 2022-05-04 16:06:54 · 2624 阅读 · 1 评论 -
nnUnet代码解读--模型训练
nnUnet代码解读(一)nnunet项目官方地址MIC-DKFZ/nnUNet准备工作关于nnUnet代码包的安装和配置参考nn-UNet使用记录–代码配置_宁眸的博客-CSDN博客确认安装nnUnet代码包,配置好环境变量,确认nnunet/run/run_training.py可以成功运行。我是一边debug一边阅读源码的,不想debug也可以直接看源码。export nnUNet_raw_data_base="/data/.../nnUNet_raw_data_base"export原创 2022-04-30 20:09:21 · 11077 阅读 · 18 评论