脑影像
文章平均质量分 76
一些科研过程中遇到的小问题
小王今天更新了吗
这个作者很懒,什么都没留下…
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医学图像的读取
filename='test1.abc';fid=fopen(filename,'rb');fseek(fid,512*512*4,'eof');Recons_P1=fread(fid,[512 512],'folat').';flcose(fid);根据每个像素的大致的字节数去猜测图像是什么数据类型的常见的数据类型:unsigned char 1字节 8bitsshort...原创 2021-07-06 15:57:32 · 142 阅读 · 0 评论 -
ANTs安装配置 未解决
ANTs 的安装主要有两种形式,一种是基于源码的安装,安装完毕后可以直接在命令行调用相应的功能,另一个种是基于 python 的安装,安装完毕后可以在 python 中直接调用相应的包进行使用。两种方式暂时只支持 Linux 和 Mac 系统。基于python在github中下载对应的包用pycharm打开项目 测试 有误基于源码:ANTs首先安装git cmak 和c++编译器2.1 安装ANTs N4BiasFieldCorrection(下载到路径"/home/自己的用户名/ " 目录原创 2021-07-06 15:57:14 · 833 阅读 · 0 评论 -
ITK-SNAP的使用
1.打开/导入图像:两种方式1)直接拖入已经导入一个图像再导入另一个分割图像的时候,会有提示选择 load as segmentation 就可以把分割的结果覆盖在原图上面2)file–open main imagesegmentation–open segmentation 也是同样的效果2.设置标签segmentation–label editor通过Actions,可以保存和导入自定义的label模板export label descriptions–导出自定义的label模原创 2021-01-07 11:40:33 · 5363 阅读 · 5 评论 -
20201229 Mac OS在跑blast-ct脑出血分割时的报错
解决方法 (允许副本存在):import osos.environ[‘KMP_DUPLICATE_LIB_OK’]=‘True’参考:https://www.cnblogs.com/peijz/p/13048119.html问题原因:numpy版本问题造成与系统之间的冲突而导致了异常解决办法:1)update the numpy package in conda2)通过在Conda环境文件夹$CONDA_PREFIX/lib中创建到OpenMP库实例的符号链接,将Conda的OpenMP库替换为原创 2020-12-29 11:23:19 · 325 阅读 · 0 评论 -
Mac系统下Niftyreg的安装
不同版本的Xcode下载地址:https://developer.apple.com/download/more/需要登录Apple ID原创 2020-12-17 10:52:44 · 607 阅读 · 5 评论 -
SPSS 性别卡方分析
1.新建数据集2.打开变量视图,分别输出group、sex和number其中标签是对数据的说明,值是spss中的显示,比如定义1=subject,则输入1就等价于subject变量视图:数据视图:3.数据分析:点击 数据–个案加权–将人数加入个案加权系数 否则结果一般有误4.卡方检验分析–描述统计–交叉表–统计–卡方检验确定结果输出:...原创 2020-12-08 11:33:39 · 12804 阅读 · 2 评论 -
颅脑相关概念
脑实质一般将脑分为端脑、间脑、中脑、脑桥、延髓和小脑六个部分,其中将中脑、脑桥和延髓合称为脑干。端脑端脑由左右两侧大脑半球和半球间联合及其内腔构成。大脑半球表面的灰质层,称为大脑皮质,深部的白质称髓质,埋在大脑髓质内的灰质核团成为基底核,大脑半球内的腔隙称谓侧脑室。间脑间脑位于端脑和中脑之间,包括背侧丘脑(丘脑)、下丘脑、上丘脑、底丘脑和后丘脑。脑干脑干位于颅后窝,自上而下由中脑、脑桥和延髓三部分组成。小脑小脑是机体重要的躯体运动调节中枢之一,其功能主要是维持身体平衡、调节肌张力以及协调原创 2020-11-17 17:13:21 · 395 阅读 · 0 评论 -
prism8 t-test
1.创建data table2.写入/导入数据3.分析analyze:4.点击results查看结果:5.画图这就是画出来的图啦!双击图上xtitle等位置,可以修改标题等。双击坐标轴,可以更改坐标轴的起点,双击柱形图,可以修改为平均值±SD/SE等。...原创 2020-05-28 14:49:33 · 542 阅读 · 0 评论 -
脑影像名词解释
3、BOLD:血氧水平依赖(blood oxygenation lev-el dependent,BOLD)法,目前应用最广泛的方法为BOLD法:血红蛋白包括含氧血红蛋白和去氧血红蛋白[1],两种血红蛋白对磁场有完全不同的影响,氧合血红蛋白是抗磁性物质,对质子弛豫没有影响,去氧血红蛋白是顺磁性物质,其铁离子有4个不成对电子,可产生横向磁化磁豫缩短效应***(preferential T2 pro...原创 2020-05-28 14:40:59 · 443 阅读 · 0 评论 -
Graphpad prism8
graphpad prism8安装教程:1.安装前建议先卸载较早版本,也可不卸载。2.打开安装程序安装64位或者32位prism8、3.将Crack文件夹中对应的64位或者32位Prism8.exe复制到prism8安装位置的文件夹中,覆盖先前文件。4.打开Prism8,成功。prism简介:项目有5个部分:-数据表-结果分析表-信息表-图-构图数据表为分析或作图输入和组...原创 2019-08-16 15:41:36 · 42520 阅读 · 17 评论