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原创 fMRI数据处理:图像质量控制
前面三篇,我们顺利的吧DICOM格式转为了NIFTI格式的文件。在开始预处理之前,还有一件很重要的事情,那就是质量控制(QC,quality control)或者叫质量评估(QA,quality access)。质量控制(QC)是功能性磁共振成像(fMRI)研究的重要阶段。通过生成的质量控制报告,研究人员可以排除具有各种问题的数据,例如:图像的缺失、明显的头部运动、低信噪比、切片不足等的图像。这里有一些个人见解,你要问它重要吗?我的回答是重要。但你说这一步非做不可吗?我认为不是必要的。
2024-06-04 15:30:14 1269
原创 fMRI数据处理:从DICOM到NIFTI(下)
上一篇我们完成了对原始DICOM的数据整理,将其整理为了BIDS目录结构。作为从从DICOM到NIFTI的最后一篇,当然是介绍如何批量将DICOM格式转NIFTI格式啦!从DICOM到NIFTI系列就完成啦!撒花★,°.°★。从核磁机器把数据拷回来——到整理成BIDS格式——到批量转格式;我们fMRI数据处理的第一步就算是正式迈出去啦!接下来的内容,敬请期待吧~
2024-06-04 02:11:15 1240
原创 fMRI数据处理:从DICOM到NIFTI(中)
上一篇简单介绍了DICOM和NIFTI格式的文件,这一篇才是数据处理真正的开篇~当我们从核磁机器上拷贝回来数据的时候,非常的杂乱无章,我们需要打开核磁拷贝下来的文本信息(例如DIR_INFO.TXT)比着被试的名字去找对应的DICOM文件夹,这种方式非常的不易阅读,命名也不够规范和统一。所以我们拿到DICOM的第一件事,应该是整理原始的DICOM文件。这篇内容呢,看似不重要,其实还挺重要的。因为一个清晰的目录结构,可以减少很多重复查看等种种不必要的工作。接下来fMRI的数据处理就正式开始了!
2024-06-04 00:15:18 735
原创 fMRI数据处理:从DICOM到NIFTI(上)
哈喽,这里是系列fMRI数据处理文章专栏。包括从核磁拷贝完DICOM格式的文件,到整理数据,检查数据,数据预处理,后续分析等等内容。如果你是一个初学者,特别是心理学或者是刚踏入认知神经科学的小白,那么这个专栏可以帮助你从头到尾完成数据处理直到结果的可视化。如果你已经进入了认知神经科学领域,这里面的内容可能过于细致,并且找不到你想要的答案,不过可以在帖子下留言评论,欢迎大家提供宝贵的意见!如果是医学相关,可能这些内不太准确或专业,谨慎参考!
2024-06-03 22:59:01 1220 1
空空如也
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