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原创 先来挖个坑(影像组学特征提取之后的事——特征筛选——去掉冗余特征)

之前在网上学习用python做lasso特征筛选时,看见评论区的一个质疑,说python的lasso不能做分类任务的特征筛选。然后看了官方文档之后,好像是不能呢,然后我就转战了R语言的lasso。具体如何实现,等有时间来更新!先记录一下问题以免忘记!

2023-12-03 10:08:10 188 1

原创 影像组学分析流程中,图像分割之后的事(特征提取以及特征数据预处理)

前情提要:关于影像组学特征,网上大多数文献采用公开的pyradiomics包进行,想要了解有哪些特征,请移步官方文档,地址:https://pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/为了方便展示结果,在featureA = pd.DataFrame([feature])后面添加一行转置代码:featureA = np.transpose(featureA)关于特征提取之后,数据分析之前的事:特征数据标准化。

2023-06-27 19:41:41 1039 1

原创 影像组学分析流程中,图像分割前要做的事(图像预处理)

在InputVolume中无法找到自己想要重采样的序列,这时可以检查一下序列的Volume type是不是MRMLMulti。这时,Volume type将由MRMLMulti改为Scaler,随后即可在3D slicer中完成Resample Scaler Volume。2.1、重采样:通过3Dslicer中的Resample Scaler Volume实现。具体设置参数:spacing(1,1,1),Interpolation选择Bspline。2、图像预处理:重采样和标准化。

2023-06-27 18:31:49 1727 1

原创 混淆矩阵计算Accuracy,IoU,dice等评价指标出现nan值

accuracy出现nan值,一定要考虑数据是否正确!!!!

2022-08-18 20:26:33 3953 1

原创 pytorch实现:数据集归一化处理

如何对数据集进行归一化处理,如何计算数据集mean(均值)和std(标准差)

2022-08-12 21:48:07 6283 4

原创 直方图均衡

**直方图均衡**I=imread(‘C:\Users\tangli\Desktop\meitu\abcde.jpg’);I=rgb2gray(I);J=histeq(I);subplot(2,2,1);imshow(I);title(‘原始图’);subplot(2,2,2);imshow(J);title(‘均衡后’);subplot(2,2,3);imhist(I)...

2019-05-03 23:20:54 111

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