4.R包相关介绍

1. 安装与加载

1.1 安装R包

不同来源的R包，有不同的安装方式。
安装R包之前，先确定来源，每个包的 包名 需要加引号。

CRAN

install.packages() #例如：install.packages("stringr")

---

Biocductor

BiocManager::install() #例如：BiocManager::install("ggplot2")

---

Github

devtools::install_github() 
#例如：devtools::install_github("jmzeng1314/idmap1")

1.2 加载R包

加载包的 包名 无需加引号。

library() # 例如：library(stringr)

# require() 导入包会返回逻辑值：TRUE 或 FALSE
require() # 例如： require(stringr)

2. 镜像配置

2.1 RStudio

点击 Tools -> Global Option -> Packages

2.2 代码设置

options("repos"=c(CRAN="http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))
options(Bioc_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")