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转载 生信linux20题作业学习笔记

转载自猪猪生信(公众号),我只是一个思考加学习的小垃圾搬运工,他是标准答案。1.在任意文件夹下面创建形如 1/2/3/4/5/6/7/8/9 格式的文件夹系列。mkdir -p 1/2/3/4/5/6/7/8/9 #递归创建文件夹tree #查看目录结构2.创建好的文件夹下面,里面创建文本文件 me.txtcd /1/2/3/4/5/6/7/8/9 #进入目录vi me.txt 3.在文本文件 me.txt 里面输入内容: Go to: http://www.biotrainee.com

2021-06-01 15:39:35 404

原创 python学习笔记(一)

1.模块import 模块from 模块 import 功能2.原始字符串在前面加个r3.tuple元组(,)可以用作映射中的键,不可变4.字符串.join()合并字符串,必须都是字符串。.split()拆分字符串.strip()删除开头或者末尾的空白.lower()将字符串都变为小写,检索时可能有用.translate()单字符串替换,但需要用maketran做一个转换表。5.字典 无序{},dict创建.formap_map(),将键和值映射输出。6.一些函数enume

2021-03-29 13:56:24 53

原创 生信数据格式学习笔记(一)

@生信数据格式1.FASTQ格式原始下机数据的存储格式,一共四行,第一行是@开头的序列标识符和描述信息,第二行是原始序列信息,第三行是以 + 开始,后面可再接与第一部分的相同的序列标识符或者描述信息,第四行是ASCII码字符表示的第二行的序列信息的测序质量。2.FASTA格式生物信息最基本的文本格式,用来展示碱基序列或者氨基酸序列第一行通常以";" 或者 ">"开头,用来分割不同的序列,后接一些信息。第二行是碱基或氨基酸序列。FASTQ格式转FASTA格式(zcat .fq.gz| pas

2021-03-22 14:56:22 347

空空如也

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