PyMC库安装中遇到的问题

过程

整个解决过程很漫长……花了我三天时间，遇到了各种报错，尝试了各种办法……如果不愿看可直接跳到后面的总结。

首先尝试直接用pip install pymc：

这里不太确定是什么问题，就换了个安装方式，从这个网站https://pypi.org/project/pymc/4.4.0/#files中下载Distribution文件:

然后尝试通过tar.gz或whl文件安装：

pip install E:\Downloads\pymc-4.4.0.tar.gz

还是报错：这里看起来像是SSLError，可能setuptools也有问题

查找SSLError解决办法，需要加一个–trusted-host，因为开了梯子，加了下面这个

–trusted-host pypi.org --trusted-host files.pythonhosted.org

还是报错：这次好像是ProxyError，可能是代理问题

然后把梯子关了再跑一遍，直接下载失败，老长一串Exception报错：

可能还是网络的问题，但还是先检查了一下pip setuptools wheel：

py -m pip install --upgrade pip setuptools wheel

不开梯子跑会很长一串Exception，最后显示ReadTimeoutError，开着梯子跑就会出现SSLError，加上–trust-host又出现ProxyError，于是干脆把梯子关了改成国内镜像：

py -m pip install --upgrade pip setuptools wheel -i http://pypi.douban.com/simple/ --trusted-host pypi.douban.com

这里将pip源换成清华源、阿里源等都适用。
这时可以成功下载最新版的pip setuptools和wheel了，也Successfully uninstalled旧版本的了，但安装新版本的时候又报了一长串错，最后显示：

ValueError: Unable to find resource t64.exe in package pip._vendor.distlib

在网上搜索解决办法，说是先卸载setuptools：

python -m pip uninstall pip setuptools

再重新安装setuptools

pip install --upgrade setuptools

但这里我直接用这个命令更新还是会报错ReadTimeoutError，所以我还是在后面加了国内镜像源，然后pip就成功更新到最新版本：

然后重新尝试安装pymc，直接安装还是报错ReadTimeoutError：

还是加上豆瓣源，这次跑得挺顺利的，但最后又报错：

ERROR: Could not install packages due to an OSError: [WinError 5] 拒绝访问。: ‘C:\Users\Dalia\AppData\Local\Programs\Python\Python39\Lib\site-packages\~umpy\.libs\libopenblas.NOIJJG62EMASZI6NYURL6JBKM4EVBGM7.gfortran-win_amd64.dll’
Consider using the --user option or check the permissions.

这应该是权限问题，在原命令的install后面加–user重新试，又报错：

ERROR: THESE PACKAGES DO NOT MATCH THE HASHES FROM THE REQUIREMENTS FILE. If you have updated the package versions, please update the hashes. Otherwise, examine the package contents carefully; someone may have tampered with them.
matplotlib>=3.5 from http://pypi.doubanio.com/packages/78/af/4c83c99656c500ca0db7fe6f349d6309372ea8bad9c78d5c161930977bfd/matplotlib-3.6.2-cp39-cp39-win_amd64.whl#sha256=5ba73aa3aca35d2981e0b31230d58abb7b5d7ca104e543ae49709208d8ce706a (from arviz>=0.13.0->pymc==4.4.0):
Expected sha256 5ba73aa3aca35d2981e0b31230d58abb7b5d7ca104e543ae49709208d8ce706a
Got e59b8be8f73ae3324e5b768fd21dd204ffdbcf0af58e1e74f04be926908027a6

在网上查找后说可能是网速问题，多试几遍，就又跑了一遍，又报了个新错误，是一个没有添加Path的警告和packages版本不兼容问题：

然后根据警告在Path中添加了路径，重新cmd打开命令再运行一遍，就发现已经安装好了？：

但是！去python中import的时候会报错：

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from IPython import display
import pymc as pm
import aesara.tensor as at
import aesara

在cmd中import也有问题：

尝试改了numpy的版本，发现会和tensorflow等其他packages不兼容，所幸先不管其他packages了，这里应该是aesara包有问题，重新安装了pymc的4.1.0版本，import也是同样的报错，如果解决了再来更新……

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更新：继续来debugg
尝试重新安装aesara包，去官网搜索安装方法，把官网仔细阅读并各种test后最终选择在github上下载code.zip，然后进入目录安装，这个时候重新运行import已经可以正常运行了，但其实还是会有警告，用官网的test方法还是有点问题。
不过还是先把代码跑通。

pm.model_to_graphviz(basic_model)

跑代码的时候这里报错了，然后去重新下载这个python-graphviz包，还是类似的命令：

pip install graphviz -i http://pypi.douban.com/simple/ --trusted-host pypi.douban.com

但还是报错：

ExecutableNotFound: failed to execute WindowsPath(‘dot’), make sure the Graphviz executables are on your systems’ PATH

查找解决办法是在开头引用的时候加上

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'D:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'

然后就没有报错了
然后开始用pymc sample，代码是：

with basic_model:
    trace = pm.sample(draws = 1000, tune = 1000, return_inferencedata=True)

但还是报错：

TypeError: cannot pickle ‘fortran’ object

查找解决办法是：在sample里面加上设定 cores=1，再运行就成功了。

总结

安装PyMC

用pip安装Pymc，去PyMC官网下载tar.gz或whl文件。
在确保pip setuptools wheel正常的情况下，直接在cmd里输入命令：

pip install --user D:\pymc.whl -i http://pypi.douban.com/simple/ --trusted-host pypi.douban.com

这里D:\pymc.whl换成自己下载的whl文件所在目录。
如果运行python代码时import pymc报错，根据报错内容，可能是aesara包的问题，可以去aesara官网查找test方法，检查错误原因，或者通过git重新安装aesara包，这里我是根据test时的报错安装了一个hypothesis库，但其实test还是有些问题，我没查到如何解决，先直接运行代码了。

运行时的问题

pm.model_to_graphviz(basic_model)

如果这个函数运行时报错，可能时pygraphviz的问题，重新安装pygraphviz包：

pip install graphviz -i http://pypi.douban.com/simple/ --trusted-host pypi.douban.com

并且在代码开头加上path设置（如果不报错也可以不加）：

import os
os.environ["PATH"] += os.pathsep + 'D:/Program Files (x86)/Graphviz2.38/bin/'

2. 如果pm.sample()报错，试试在里面设置 cores=1

暂时就这些报错问题和解决办法。