各位学友大家好,这几天好几个外院的老师,问我如何将自己的csv表格导入mimic数据库,这样便于对自己筛选的hadm_id进行进一步的比对。这个问题其实很简单,mimic数据库本身就是关系型数据库,用几句简单的postgresql语句就能实现。我们以导入本地的ccs_multi_dx.csv表格为例。首先是在postgresql的可视化界面构建新的表格。表格构建好以后
通过下面的语句进入自己的数据库
然后直接用最常用的sql语句导入就行了
这个表格就可以顺利的导入了。
另外,还有很多外院的老师问我如何删除pg_tables
系统下schemas下的所有表格
DO $$ DECLARE
r RECORD;
BEGIN
-- replace 'public' with the schema name
FOR r IN (SELECT tablename FROM pg_tables WHERE schemaname = 'public') LOOP
EXECUTE 'DROP TABLE IF EXISTS public.' || quote_ident(r.tablename) || ' CASCADE';
END LOOP;
END $$;
代码如上
还有老师问,mimic数据库占c盘太多了,如何转移盘符
首先,创建一个表空间并指定其位置。例如,假设您希望将数据库安装在D盘的一个文件夹中,您可以这样操作:
CREATE TABLESPACE my_tablespace LOCATION 'D:/myfolder';
然后,当创建新的数据库时,您可以指定其表空间:
CREATE DATABASE my_database TABLESPACE my_tablespace;
下面是可复制的操作
postgres=# CREATE TABLESPACE mimiciii_ts LOCATION 'E:/mimiciii_cv_folder';
CREATE TABLESPACE
postgres=# CREATE DATABASE mimiciii_cv WITH OWNER postgres TABLESPACE mimiciii_ts;
CREATE DATABASE
postgres=# \c mimiciii_cv;
您现在已经连接到数据库 "mimiciii_cv",用户 "postgres".
mimiciii_cv=# CREATE SCHEMA mimiciii;
CREATE SCHEMA
mimiciii_cv=# \set search_path to mimiciii;
mimiciii_cv=# \i F:/datamimic/postgres_create_tables.sql
好了,希望大家多多支持天津市环湖医院数据科学