放开我头发-CSDN博客

原创 fMRI数据集

数据集的网址如下所示。NKI 增强数据集包含原始 SMRI 和 rs-fMRI 数据，可在 http://fcon_1000.proj-ects.nitrc.org/indi/enhanced/neurodata.html 获得。MPI-Leipzig-Mind-Brain-Body 数据集可在DATA在线获取。闭眼数据集可在OpenNeuro在线获取。...

2022-02-21 16:10:59 676

import SimpleITK as sitkimport osimport pydicomimport matplotlib.pyplot as pltos.chdir( 'C:\\Users\\xxxx\\Desktop\\DemoData\\DemoRaw\\DemoData\\FunRaw')#避免因路径中含中文导致SimpleITK无法读取def dcm2nii(dcms_path, nii_path): # 1.构建dicom序列文件阅读器，并执行（即将dicom序列文件“.

2022-02-16 11:06:46 1861 2

原创 python批量改变图像大小

from PIL import Image #python3安装pillow库import os.pathimport globdef convertSize(jpgfile,outdir,width=256,height=256): #图片的大小256*256 img = Image.open(jpgfile) try: new_img = img.resize((width, height), Image.BILINEAR) ''' .

2021-12-14 20:29:57 4874 1

原创批量重命名数据集数据

import osos.chdir('XXX') #数据集存储路径 for i, img in enumerate(os.listdir()): name = str(i) ext = os.path.splitext(img)[-1] #获取文件类型后缀 os.rename(img,f"{name}{ext}")效果

2021-12-14 18:02:01 697

原创 Hu不变矩

模式识别课期末作业：静态手势识别特征向量：Hu不变矩代码：function [data_vec]= mat2vector_bbj(data,sample_num) % mat2vector_bbj.m % 输入：图片数据（矩阵），样本个数 % 函数作用：提取Hu不变矩，每个向量作为一张图片的特征 % 输出：样本数*图片像素数量大小的矩阵 for i = 1 : sample_num I=data(:,:,i); [x,y]=meshgrid(1:M,1:

2021-12-13 21:23:21 369

原创 VBM法MRI图像处理——记第一次使用cat12

1.环境MATLAB 2015bSPM12CAT122.SPM部分命令行输入spm出现以及点击Toolbox出现3.CAT部分点击上图设置请根据自己需求多分割了一种surface皮层数据，当做皮层统计分析SBM时需要提取surface皮层指标时会用到。我本意只是获得灰质、白质的体积，建议设置NO，不然跑好久。省略添加.nii文件......开始run，得到结果其中mri文件夹里剩下四种命名的.nii文...

2021-12-13 21:22:19 5819 6

原创 MRI数据处理

1.数据集ADNI2.工具包NIFTI上GitHub下载了一个，放到MATLAB的toolbox目录下，并设置路径3.loadnii = load_nii( 'ADNI_011_S_1080_MR_MPR__GradWarp__B1_Correction__N3__Scaled_Br_20070109192452043_S23159_I35591.nii' );view_nii(nii)效果：4.问题①如何三维建模②如何大脑分区...

2021-12-07 10:58:08 578

转载 fMRI数据集汇总

功能性磁共振成像（fMRI，functional Magnetic Resonance Imaging）是一种神经影像学技术。其原理是利用磁振造影来测量神经元活动所引发之血液动力的改变。由于fMRI的非侵入性和其较少的辐射暴露量，从1990年代开始其就在脑部功能定位领域占有了重要地位。目前，fMRI主要被运用于对人及动物的脑或脊髓之研究中。目前常用的fMRI（MRI）公开数据集：01OpenfMRI 数据库OpenfMRI是一个以fMRI数据集为主的数据库，大多数数据集会附有使用该数据集发表的文

2021-11-16 22:27:59 3396 1

weixin_46141330的博客