VBM法MRI图像处理——记第一次使用cat12

1.环境

MATLAB 2015b

SPM12

CAT12

2.SPM部分

命令行输入

spm

出现

以及 

 点击Toolbox

 出现

 3.CAT部分

点击上图

 设置请根据自己需求

多分割了一种surface皮层数据，当做皮层统计分析SBM时需要提取surface皮层指标时会用到。

我本意只是获得灰质、白质的体积，建议设置NO，不然跑好久。

省略添加.nii文件......开始run，得到结果

其中mri文件夹里剩下四种命名的.nii文件——mwp1xxx.nii（标准化灰质体积图像）、mwp2xxx.nii（标准化白质体积图像）、p0xxx.nii（原始图像）、wmxxx.nii（剥脑&标准化T1图，盲猜是模板图得出来的，与输入无关，没贴图）

 从左到右：原图->去了脑壳->白质->灰质

在report的pdf文件里

 

• TIV:颅内总容积total intracranial volume
• GM:灰质
• WM:白质
• CSF:脑脊液 cerebrospinal fluid
• WMH:白质高信号区 white matter hyperintensities（没算出来，出错了）

悲剧啊，算体积的时候出错了，555

下一步计划：分离海马体并算各部分体积。

参考文章：基于cat12和SPM12进行VBM&SBM数据分析笔记1——数据预处理_Sophia2023的博客-CSDN博客_vbmjian