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RSS订阅原创 LSTM的学习
1、LSTM**长短期记忆（Long short-term memory, LSTM）**是一种特殊的RNN。主要是为了解决长序列训练过程中的梯度消失和梯度爆炸问题。简单来说，就是相比普通的RNN，LSTM能够在更长的序列中有更好的表现。相比RNN只有一个传递状态 h ，LSTM有两个传输状态，一个 c （cell state），和一个 h（hidden state）。（Tips：RNN中的 h对于LSTM中的 c ） 其中对于传递下去的 c改变得很慢，通常输出的c 是上一个状态传过来
2022-05-26 21:28:32
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原创 单细胞数据分布 ZINB的理解
单细胞RNA测序(single-cell RNA-seq，scRNA-seq)数据是非常有特点的数据，具有很高的稀疏性(high sparsity)，具体表现为0非常多(zero inflation)。对于数据的分布给出合理的假设是非常关键的工作，是downstream analysis的基础。显然对于scRNA-seq的reads count数据，最常用的正态分布是不合理的。首先正态分布描述的是连续型数据，而reads count数据是离散的；其次reads count数据的取值只能为非负整数。经过不断的
2022-05-07 20:04:10
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原创 RNN循环神经网络 从零开始
神经网络基础神经网络可以当做是能够拟合任意函数的黑盒子，只要训练数据足够，给定特定的x，就能得到希望的y，结构图如下：将神经网络模型训练好之后，在输入层给定一个x，通过网络之后就能够在输出层得到特定的yRNNRNN（Recurrent Neural Network）是一类用于处理序列数据的神经网络。首先我们要明确什么是序列数据，摘取百度百科词条：时间序列数据是指在不同时间点上收集到的数据，这类数据反映了某一事物、现象等随时间的变化状态或程度。这是时间序列数据的定义，当然这里也可以不是时间，比如文字
2022-05-04 18:19:57
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原创 用python调用r包
安装rpy2pip install rpy2加载%load_ext rpy2.ipython使用r包之前%%R例如%%Rrm(list = ls())library(ggplot2)
2022-05-03 17:37:53
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原创 在jupyter中使用虚拟环境
首先得有虚拟环境conda create -n my-conda-env # creates new virtual envconda activate my-conda-env # activate environment in terminal在虚拟环境中安装 ipykernelconda install ipykernel # install Python kernel in new conda envipython kernel install --user -
2022-05-03 15:36:37
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原创 anaconda创建虚拟环境的相关
在anaconda命令行输入conda create -n env_name python=3.8激活conda activate env_name在这个虚拟环境中安装新的库前提是激活了你要安装库的虚拟环境conda install library_name退出虚拟环境conda deactivate查看已有的虚拟环境conda env list删除环境conda remove -n env_name --all删除环境中的某个包conda remove --name
2022-05-03 12:23:15
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原创 python求相关系数
记录一下作业import matha = [23,23,27,27,39,41,47,49,50,52,54,54,56,57,58,58,60,61]b =[9.5,26.5,7.8,17.8,31.4,25.9,27.4,31.2,34.6,42.5,28.8,33.4,30.2,34.1,32.9,41.2,35.7]"""a1 = input("请输入年龄：")a = [int(i) for i in a1.split()]b1 = input("请输入%fat")b = [flo
2021-11-20 12:00:58
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原创 Anaconda安装或更新 Python 第三方包的方法
**需要用到 conda和pip，首先了解**condaconda是包及其依赖项和环境的管理工具。适用语言：Python, R, Ruby, Lua, Scala, Java, JavaScript, C/C++,FORTRAN。适用平台：Windows, macOS, Linux用途：快速安装、运行和升级包及其依赖项。在计算机中便捷地创建、保存、加载和切换环境。如果你需要的包要求不同版本的Python，你无需切换到不同的环境，因为conda同样是一个环境管理器。仅需要几条命令，你可
2021-11-17 10:17:57
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原创 第一次注册github失败解决办法，必看！
新手小白，第一次注册GitHub，填好用户名邮箱密码后进入下一步就卡在哪里，上面还提示Unable to verify your captcha response等，进入网址的解决办法以及下载其他的浏览器也无法解决突然想到了手机浏览器，抱着试一试的心态竟然成功了，分享给大家手机下载谷歌浏览器，进入GitHub正常注册，能向下继续，邮箱验证完以后再用电脑登陆就ok啦！...
2021-04-09 23:03:41
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空空如也
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