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生态
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xiao5kou4chang6kai4
xiao5kou4chang6kai4 的博客
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基于R语言BIOMOD2 及机器学习方法的物种分布模拟与案例分析------生物多样性保护、气候变化影响评估和入侵物种管理
BIOMOD2模型的运行涉及多个步骤,包括物种分布文件的建立、环境变量的选择、模型参数及其设置、模型算法介绍及主要参数等。1、理解物种分布模型的基本原理:理解物种分布模型(SDMs)的理论基础,包括模型的种类、用途以及在生态研究和环境管理中的应用。2、掌握BIOMOD2软件包的使用:在R环境中有效地使用BIOMOD2软件包,包括数据准备、模型构建、模型评估和结果解释。3、提高数据分析和处理能力:获取、处理和分析环境与物种数据的能力,包括数据清洗、变量选择和模型优化。原创 2024-07-02 09:01:07 · 494 阅读 · 0 评论 -
【BIOMOD2模型】未来气候变化下的情景预测、物种适生区的变化分析以及MESS分析过程的实现
BIOMOD2模型的运行涉及多个步骤,包括物种分布文件的建立、环境变量的选择、模型参数及其设置、模型算法介绍及主要参数等。1、理解物种分布模型的基本原理:理解物种分布模型(SDMs)的理论基础,包括模型的种类、用途以及在生态研究和环境管理中的应用。2、掌握BIOMOD2软件包的使用:在R环境中有效地使用BIOMOD2软件包,包括数据准备、模型构建、模型评估和结果解释。3、提高数据分析和处理能力:获取、处理和分析环境与物种数据的能力,包括数据清洗、变量选择和模型优化。原创 2024-06-24 14:38:43 · 429 阅读 · 0 评论 -
Python语言在地球科学交叉领域中的实践
Python是功能强大、免费、开源,实现面向对象的编程语言,Python能够运行在Linux、Windows、Macintosh、AIX操作系统上及不同平台(x86和arm),Python简洁的语法和对动态输入的支持,再加上解释性语言的本质,使得它在大多数平台上的许多领域都是一个理想的脚本语言,特别适用于快速的应用程序开发。Python具有丰富和强大的库,能够把用其他语言制作的各种模块(尤其是C/C++)很轻松地联结在一起。原创 2024-06-07 17:00:08 · 580 阅读 · 0 评论 -
Earth Engine(GEE)遥感云大数据分析、管理与可视化及洪涝灾害监测、干旱遥感监测、物候特征分析、森林植被健康状态监测、生态环境质量动态监测案例
遥感数据的空间、时间、光谱分辨率及数据量均大幅提升,呈现出大数据特征。这为相关研究带来了新机遇,但同时也带来巨大挑战。传统的工作站和服务器已无法满足大区域、多尺度海量遥感数据处理需求。为解决此问题,全球涌现出多个地球科学数据在线可视化计算和分析云平台,如谷歌Earth Engine(GEE)、航天宏图PIE Engine和阿里AI Earth等。原创 2024-06-07 15:48:23 · 913 阅读 · 0 评论 -
【Apsim模型】精细农业、水肥管理、气候变化、粮食安全、土壤碳周转、环境影响、农业可持续性、农业生态领域
APSIM模型有Classic和Next Generation两个系列模型,能模拟几十种农作物、牧草和树木的土壤-植物-大气过程,被广泛应用于精细农业、水肥管理、气候变化、粮食安全、土壤碳周转、环境影响、农业可持续性、农业生态等诸多与农业生产和科研有关的领域。R语言是一门应用场景广泛、简单易学的程序语言,APSIM模型开发了许多R语言辅助包,在APSIM模型的气候、土壤、管理措施等数据准备,自动化模拟,参数优化和结果分析上都发挥着重要的作用。案例一:使用R语言进行气象文件的生成。土壤水蒸散和植物蒸腾算法。原创 2024-06-06 15:04:09 · 1016 阅读 · 0 评论 -
R语言BIOMOD2 及机器学习方法的物种分布模拟
BIOMOD2模型的运行涉及多个步骤,包括物种分布文件的建立、环境变量的选择、模型参数及其设置、模型算法介绍及主要参数等。1、理解物种分布模型的基本原理:理解物种分布模型(SDMs)的理论基础,包括模型的种类、用途以及在生态研究和环境管理中的应用。2、掌握BIOMOD2软件包的使用:在R环境中有效地使用BIOMOD2软件包,包括数据准备、模型构建、模型评估和结果解释。3、提高数据分析和处理能力:获取、处理和分析环境与物种数据的能力,包括数据清洗、变量选择和模型优化。原创 2024-06-05 16:48:29 · 482 阅读 · 0 评论 -
长时间序列遥感数据处理及在全球变化、物候提取、植被变绿与固碳分析、生物量估算与趋势分析
植被是陆地生态系统中最重要的组分之一,也是对气候变化最敏感的组分,其在全球变化过程中起着重要作用,能够指示自然环境中的大气、水、土壤等成分的变化,其年际和季节性变化可以作为地球气候变化的重要指标。目前已经从卫星获取的遥感数据反演了许多长时序生物物理参量产品,如GIMMS3g NDVI/LAI/FAPAR、MODIS NDVI/LAI/FAPAR/ GPP、GLASS LAI/FVC/GPP等,并且已经广泛应用于全球或区域尺度植被变化趋势及格局分析。经QC后的产品最大值/均值/中值等合成。原创 2024-05-31 16:32:33 · 271 阅读 · 0 评论 -
AquaCrop模型原理、数据准备、运行及结果分析、参数分析、源代码分析
AquaCrop是由世界粮食及农业组织(FAO)开发的一个先进模型,旨在研究和优化农作物的水分生产效率。这个模型在全球范围内被广泛应用于农业水管理,特别是在制定农作物灌溉计划和应对水资源限制方面显示出其强大的实用性。模型的核心优势在于其独特的水分管理能力,能够精确模拟作物生长过程中水分的需求与消耗,帮助农业工作者制定更为科学和高效的灌溉策略。通过对作物的水分需求和供应的精确计算,AquaCrop 能够帮助提高水资源的使用效率,优化作物产量和质量。1. AquaCrop模型的应用范围。3.模型输入数据要求。原创 2024-05-29 17:09:29 · 517 阅读 · 0 评论 -
ChatGPT4助力决策树、随机森林、Adaboost、XGBoost和LightGBM近红外光谱分析
ChatGPT4.0在科研工作中的各种使用方法与技巧,以及人工智能领域经典机器学习算法(BP神经网络、支持向量机、决策树、随机森林、变量降维与特征选择、群优化算法等)和热门深度学习方法(卷积神经网络、迁移学习、自编码器、U-Net等)的基本原理及Python、Pytorch代码实现方法。2、遗传算法(Genetic Algorithm)的基本原理(什么是个体和种群?7、张量(Tensor)的运算(加法、减法、矩阵乘法、哈达玛积(element wise)、除法、幂、开方、指数与对数、近似、裁剪)原创 2024-05-28 16:12:40 · 1043 阅读 · 0 评论 -
土壤风蚀模拟与风蚀模数估算、变化归因分析中的实践应用
修正的土壤风蚀方程(revised wind erosion equation,RWEQ)被广泛应用于土壤风蚀预报原创 2024-05-28 16:06:37 · 563 阅读 · 0 评论 -
作物水文模型AquaCrop---用于评估作物对水的需求、灌溉计划和管理策略
运用2017-2018年南疆绿洲区膜下滴灌棉花土壤水分、冠层覆盖度、生物量、蒸散量(ET)及产量(Y)数据,校准和验证AquaCrop模型中作物参数,将数据输入AquaCrop模型气象、作物、灌溉、田间管理模块模拟了6种灌溉水平(18、24、30、36、45和54mm)和5个播期(3月23日、4月3日、4月13日、4月23日和5月3日)共30种情景下南疆绿洲区膜下滴灌棉花的生物量和产量,并分析1988-2017年连续30a棉花产量的稳定性和可持续性。王洪博 李国辉 徐雪雯 黄维雄 赵泽艺 高阳 王兴鹏。原创 2024-05-23 15:09:15 · 968 阅读 · 0 评论 -
ChatGPT自然科学应用,R语言lavaan结构方程模型、copula函数
1)R及Rstudio介绍:背景、软件及程序包安装、基本设置等2)R语言基本操作,包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等3)R语言数据文件读取、整理(清洗)、结果存储等(含tidverse)4)R语言基础绘图(含ggplot):基本绘图、排版、发表质量绘图输出存储。原创 2024-05-22 14:46:11 · 1172 阅读 · 0 评论 -
R语言lavaan结构方程模型(SEM)
结构方程模型(Sructural Equation Modeling,SEM)是分析系统内变量间的相互关系的利器,可通过图形化方式清晰展示系统中多变量因果关系网,具有强大的数据分析功能和广泛的适用性,是近年来生态、进化、环境、地学、医学、社会、经济等众多领域应用十分广泛的统计方法。在R语言结构方程程序包中,lavaan具有简洁的语法结构、成熟模型构建和调整过程和稳定可靠的结果等特点,使其不亚于收费商业软件,是最受欢迎的结构方程模型程序包之一。1)R及Rstudio介绍:背景、软件及程序包安装、基本设置等。原创 2024-05-21 14:20:50 · 760 阅读 · 0 评论 -
SEM结构方程模型之lavaan空间自相关数据分析
训练内容包括R语言入门、结构方程模型原理简介、lavaan包简介及应用案例、潜变量分析、复合变量分析、非线性/非正态/缺失数据、分类变量、分组数据、嵌套/分层/多水平数据、重复测量和时间数据、空间数据及非递归模型。)是分析系统内变量间的相互关系的利器,可通过图形化方式清晰展示系统中多变量因果关系网,具有强大的数据分析功能和广泛的适用性,是近年来生态、进化、环境、地学、医学、社会、经济等众多领域应用十分广泛的统计方法。2) R语言基本操作,包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等。原创 2024-05-17 22:27:28 · 519 阅读 · 0 评论 -
AquaCrop模型独特的水分管理能力
为了让更多的科研人员和农业工作者能够深入理解AquaCrop模型的原理,有效地运用这一工具,将详细讲解AquaCrop模型的各个组成部分,包括气象、土壤、作物和管理措施等数据的准备和输入。通过模型的实践操作和结果分析,让参与者能够不仅理解模型背后的科学原理,同时掌握如何在实际工作中应用模型来解决问题。模型的核心优势在于其独特的水分管理能力,能够精确模拟作物生长过程中水分的需求与消耗,帮助农业工作者制定更为科学和高效的灌溉策略。1. AquaCrop模型的应用范围。3.模型输入数据要求。原创 2024-05-17 22:24:37 · 310 阅读 · 0 评论 -
R语言贝叶斯方法在生态环境领域中的应用
回归及结构方程模型概述及数据探索;R和Rstudio简介及入门和作图基础;R语言数据清洗-tidyverse包;贝叶斯回归与混合效应模型;贝叶斯计数数据分析、贝叶斯空间、时间及系统发育相关数据分析;贝叶斯非线性数据分析;贝叶斯结构方程模型及统计结果绘图等原创 2024-05-15 11:58:11 · 828 阅读 · 0 评论 -
如何评价 OpenAI 2024 Spring 发布的支持实时语音对话的模型 GPT-4O?
3) 国内外经典大模型(ChatGPT、LLaMA、Gemini、DALL·E、Midjourney、Stable Diffusion、星火大模型、文心一言、千问等)案例10.2:使用大模型指令绘制柱状图(误差线)、散点图、相关网络图、热图、小提琴图、箱型图、雷达图、玫瑰图、气泡图、森林图、三元图、三维图等各类科研图。5) 主成分分析、LDA、NMS、T-SNE、UMAP、Kmeans、Agglomerative、DBSCAN。4) 特征工程、数据分割、目标函数、参数优化、交叉验证、超参数寻优。原创 2024-05-14 13:55:27 · 935 阅读 · 0 评论 -
ChatGPT大模型提问框架、论文助手、数据清洗、统计分析、经典统计模型、优化算法、机器/深度学习、二次开发、科研绘图、GIS应用、项目基金助手、AI绘图
3) 国内外经典大模型(ChatGPT、LLaMA、Gemini、DALL·E、Midjourney、Stable Diffusion、星火大模型、文心一言、千问等)案例9.2:使用大模型指令绘制柱状图(误差线)、散点图、相关网络图、热图、小提琴图、箱型图、雷达图、玫瑰图、气泡图、森林图、三元图、三维图等各类科研图。主成分分析、LDA、NMS、T-SNE、UMAP、Kmeans、Agglomerative、DBSCAN。特征工程、数据分割、目标函数、参数优化、交叉验证、超参数寻优。原创 2024-05-14 11:14:02 · 512 阅读 · 0 评论 -
【贝叶斯】贝叶斯网络、贝叶斯统计、贝叶斯参数估计等
1) SEM的定义、生态学领域应用及历史回顾2) SEM的基本结构3) SEM的估计方法4) SEM的路径规则5) SEM路径参数的含义6) SEM分析样本量及模型可识别规则7) SEM构建基本流程如何通过数据探索避免常见统计问题数据缺失(missing value)零值(zero trouble)奇异值/离群值(outliers)异质性(heterogeneity)数据分布正态性(normality)响应变量与预测变量间关系(relationships)原创 2024-05-13 16:18:05 · 1500 阅读 · 0 评论 -
利用piecewiseSEM解决构建结构方程模型过程中的众多困扰
训练内容包括R语言入门、结构方程模型原理简介、piecewise包简介及应用案例、非正态分布变量分析、嵌套/分层/多水平数据分析、重复测量和时间数据分析、空间自相关数据分析、系统发育数据分析、复合变量分析、分类变量、非线性数据及数据分组分析。在R语言结构方程程序包中,piecewiseSEM语法简洁,将结构方程模型拆分为多个组分(component)模型进行拟合和评估,可与混合效应模型实现无缝对接,在应对研究系统中复杂数据结构和类型,如多层数据嵌套和非正态分布类型变量(二项分布、泊松分布),有明显的优势。原创 2024-05-12 17:55:24 · 692 阅读 · 0 评论 -
结合大量的精选实例掌握GPT技术的实际效果
3) 国内外经典大模型(ChatGPT、LLaMA、Gemini、DALL·E、Midjourney、Stable Diffusion、星火大模型、文心一言、千问等)案例9.2:使用大模型指令绘制柱状图(误差线)、散点图、相关网络图、热图、小提琴图、箱型图、雷达图、玫瑰图、气泡图、森林图、三元图、三维图等各类科研图。主成分分析、LDA、NMS、T-SNE、UMAP、Kmeans、Agglomerative、DBSCAN。特征工程、数据分割、目标函数、参数优化、交叉验证、超参数寻优。原创 2024-05-12 17:51:17 · 368 阅读 · 0 评论 -
现代R语言【Tidyverse、Tidymodel】的机器学习
机器学习已经成为继理论、实验和数值计算之后的科研“第四范式”,是发现新规律,总结和分析实验结果的利器。机器学习涉及的理论和方法繁多,编程相当复杂,一直是阻碍机器学习大范围应用的主要困难之一,由此诞生了Python,R,SAS,STAT等语言辅助机器学习算法的实现。tidymodels,一个符合tidyverse原则的建模框架,包括了一系列包来完成这个美好的使命。这一系列包,各自肩负着自己的责任,以融洽的方式在一起构成了。设计和构建的有利于建模和机器学习的一系列包集合。4.Lasso回归与最小角度回归。原创 2024-05-11 16:10:41 · 211 阅读 · 0 评论 -
智慧农业【农业作物模型】DSSAT、DNDC、WOFOST、PCSE、APSIM、作物同化等
作物模型,即作物生长模拟模型(或称作物生长模型),是从系统科学的角度,基于作物生理过程机制,将气候、土壤、作物品种和管理措施等对作物生长的影响因素作为一个整体系统的数值模拟系统原创 2024-05-09 16:46:29 · 1427 阅读 · 0 评论 -
基于R语言地理加权回归、主成份分析、判别分析等空间异质性数据分析
在自然和社会科学领域有大量与地理或空间有关的数据,这一类数据一般具有严重的空间异质性,而通常的统计学方法并不能处理空间异质性,因而对此类型的数据无能为力。以地理加权回归为基础的一系列方法:经典地理加权回归,半参数地理加权回归、多尺度地理加权回归、地理加权主成份分析、地理加权判别分析是处理这类数据的有效模型。6.共线性与变量选择:地理加权回归中的岭回归与Lasso回归。3.广义地理加权回归:链接函数,泊松回归与二项式回归。2.地理加权回归:基本方法与稳健方法,异常值的检验。8.QGIS中的地理加权回归。原创 2024-05-08 15:24:59 · 235 阅读 · 0 评论 -
【生态系统服务】MAXENT、PLUS、USLE、INVEST、供需、VORS、SRP模型、SolVES、NPP及碳源、碳汇、CENTURY、生态经济学
生态系统服务功能、海洋生态系统淡水生态系统;陆地生态系统、碳储量原创 2024-05-08 15:23:03 · 852 阅读 · 0 评论 -
MATLAB近红外光谱分析技术及应用
基于二进制遗传算法的近红外光谱波长筛选原创 2024-05-07 16:57:37 · 325 阅读 · 0 评论 -
lavaan空间自相关数据分析
训练内容包括R语言入门、结构方程模型原理简介、lavaan包简介及应用案例、潜变量分析、复合变量分析、非线性/非正态/缺失数据、分类变量、分组数据、嵌套/分层/多水平数据、重复测量和时间数据、空间数据及非递归模型。结构方程模型(Sructural Equation Modeling,SEM)是分析系统内变量间的相互关系的利器,可通过图形化方式清晰展示系统中多变量因果关系网,具有强大的数据分析功能和广泛的适用性,是近年来生态、进化、环境、地学、医学、社会、经济等众多领域应用十分广泛的统计方法。原创 2024-05-05 21:54:15 · 258 阅读 · 0 评论 -
自然科学领域基于ChatGPT大模型的科研绘图
3) 国内外经典大模型(ChatGPT、LLaMA、Gemini、DALL·E、Midjourney、Stable Diffusion、星火大模型、文心一言、千问等)案例9.2:使用大模型指令绘制柱状图(误差线)、散点图、相关网络图、热图、小提琴图、箱型图、雷达图、玫瑰图、气泡图、森林图、三元图、三维图等各类科研图。主成分分析、LDA、NMS、T-SNE、UMAP、Kmeans、Agglomerative、DBSCAN。特征工程、数据分割、目标函数、参数优化、交叉验证、超参数寻优。原创 2024-05-04 18:56:07 · 727 阅读 · 0 评论 -
lavaan处理非线性/非正态/缺失数据
训练内容包括R语言入门、结构方程模型原理简介、lavaan包简介及应用案例、潜变量分析、复合变量分析、非线性/非正态/缺失数据、分类变量、分组数据、嵌套/分层/多水平数据、重复测量和时间数据、空间数据及非递归模型。)是分析系统内变量间的相互关系的利器,可通过图形化方式清晰展示系统中多变量因果关系网,具有强大的数据分析功能和广泛的适用性,是近年来生态、进化、环境、地学、医学、社会、经济等众多领域应用十分广泛的统计方法。2) R语言基本操作,包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等。原创 2024-05-01 18:12:18 · 24 阅读 · 0 评论 -
Python语言在地球科学交叉领域
除了Python标准库,几乎所有行业领域都有相应的Python软件库,随着NumPy、SciPy、Matplotlib和Pandas等众多Python应用程序库的开发,Python在科学和工程领域地位日益重要,在数据处理、科学计算、数学建模、数据挖掘和数据可视化方面的优异性能使得Python在地球科学中地理、气象、气候变化、水文、生态、传感器等领域的学术研究和工程项目中得到广泛应用并高效解决各种数据分析问题,可以预见未来Python将成为科学和工程领域的主流程序设计语言。原创 2024-04-28 17:07:04 · 636 阅读 · 0 评论 -
如何用ChatGPT复现nature正刊论文,自然科学领域人员必看
面向科研选题、思维导图、数据清洗、统计分析、高级编程、代码调试、算法学习、机器/深度学习、大尺度模拟、论文检索、写作、翻译、润色、文献辅助阅读、文献信息提取、辅助论文审稿、新闻撰写、科技绘图、地学绘图(GIS地图绘制)、概念图生成、图像识别、教学课件、教学案例生成、基金润色、专业咨询、文件上传和处理、机器/深度学习训练与模拟、大模型API二次开发等原创 2024-04-25 14:22:10 · 816 阅读 · 0 评论 -
lavaan复合变量(composite)分析及在生态学领域应用情景分析
训练内容包括R语言入门、结构方程模型原理简介、lavaan包简介及应用案例、潜变量分析、复合变量分析、非线性/非正态/缺失数据、分类变量、分组数据、嵌套/分层/多水平数据、重复测量和时间数据、空间数据及非递归模型。)是分析系统内变量间的相互关系的利器,可通过图形化方式清晰展示系统中多变量因果关系网,具有强大的数据分析功能和广泛的适用性,是近年来生态、进化、环境、地学、医学、社会、经济等众多领域应用十分广泛的统计方法。2) R语言基本操作,包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等。原创 2024-04-19 16:43:59 · 825 阅读 · 0 评论 -
ChatGPT及GIS、生物、地球、农业、气象、生态、环境科学领域案例
ChatGPT面向科研选题、思维导图、数据清洗、统计分析、高级编程、代码调试、算法学习、机器/深度学习、大尺度模拟、论文检索、写作、翻译、润色、文献辅助阅读、文献信息提取、辅助论文审稿、新闻撰写、科技绘图、地学绘图(GIS地图绘制)、概念图生成、图像识别、教学课件、教学案例生成、基金润色、专业咨询、文件上传和处理、机器/深度学习训练与模拟、大模型API二次开发等原创 2024-04-17 11:10:04 · 985 阅读 · 0 评论 -
GPT与R语言回归模型(lm&glm)、混合效应模型、多元统计分析
GPT的介入为数据处理、模型构建和结果解释带来了前所未有的便利。本次训练营涵盖了从GPT入门,到R语言基础与作图、回归模型分析、混合效应模型、多元统计分析及结构方程模型、Meta分析、随机森林模型及贝叶斯回归分析综合应用等一系列专题及实战案例。2.2 GPT辅助约束排序(RDA、db-RDA)分析:数据筛选、变量选择、结果解读及作图。2.1 GPT辅助非约束排序(PCA、PCoA、NMDS)分析:模型选择、结果解读及作图。3.2 GPT辅助二项分布(0,1)混合效应模型案例:数据检查、模型构建、结果展示。原创 2024-04-09 13:57:21 · 981 阅读 · 0 评论 -
GIS、RS、VORS模型、CCDM模型、geodetecto、GWR模型集成的生态系统健康的耦合协调分析
城镇化与生态系统健康的空间关系原创 2024-04-07 13:56:05 · 953 阅读 · 0 评论 -
R语言lavaan结构方程模型在生态学研究中的应用介绍及要点回顾
lavaan潜变量分析、lavaan复合变量(composite)分析原创 2024-04-07 13:44:43 · 760 阅读 · 0 评论 -
DNDC模型对所有处理的土壤温度和湿度模拟效果良好,但有时土壤湿度模拟存在偏差
DNDC(Denitrification-Decomposition,反硝化-分解模型)是目前国际上最为成功的模拟生物地球化学循环的模型之一原创 2024-04-02 15:44:34 · 609 阅读 · 0 评论 -
R语言lavaan结构方程模型(SEM)、潜变量分析、复合变量分析、非线性/非正态/缺失数据、分类变量、分组数据、嵌套/分层/多水平数据、重复测量和时间数据、空间数据及非递归模型
在R语言结构方程程序包中,lavaan具有简洁的语法结构、成熟模型构建和调整过程和稳定可靠的结果等特点,使其不亚于收费商业软件,是最受欢迎的结构方程模型程序包之一原创 2024-03-28 14:08:52 · 1353 阅读 · 0 评论 -
dndc模型:可以模拟几乎所有陆地生态系统的动态模拟模型
DNDC(Denitrification-Decomposition,反硝化-分解模型)是目前国际上最为成功的模拟生物地球化学循环的模型之一原创 2024-03-27 15:06:22 · 799 阅读 · 0 评论 -
GPT大语言模型助力R语言开展数据统计分析
R语言基础与作图、回归模型分析、混合效应模型、多元统计分析及结构方程模型、Meta分析、随机森林模型及贝叶斯回归分析综合应用等原创 2024-03-26 17:26:58 · 1074 阅读 · 0 评论