【软件工具】文件内容按行合并，并且使用了指定的制表符作为分隔符

方法一、

要将 2.txt 文件的内容按行拼接在 /home/SunlabSharedFolder/shun/LncRNA_ORF_region_0806/info/Rattus_basic_info.txt 文件的每一行后面，并使用制表符作为分隔符，你可以使用以下的 Bash 脚本：

步骤：

1. 使用 paste 命令：

   paste 命令可以将多个文件的内容按行合并，并且可以指定分隔符。

2. 执行命令：

   paste /home/SunlabSharedFolder/shun/LncRNA_ORF_region_0806/info/Rattus_basic_info.txt 2.txt > combined_file.txt
   

   这个命令将 Rattus_basic_info.txt 和 2.txt 的每一行按顺序合并，使用制表符分隔，并将结果保存到 combined_file.txt 中。

3. 替换原文件（如果需要）：

   如果你希望将结果直接覆盖 Rattus_basic_info.txt，可以再执行以下命令：

   mv combined_file.txt /home/SunlabSharedFolder/shun/LncRNA_ORF_region_0806/info/Rattus_basic_info.txt
   

完整脚本

如果你想将所有步骤放在一个脚本中，可以使用以下脚本：

#!/bin/bash

# 文件路径
target_file="/home/SunlabSharedFolder/shun/LncRNA_ORF_region_0806/info/Rattus_basic_info.txt"
source_file="2.txt"

# 拼接文件内容，使用制表符分隔
paste "$target_file" "$source_file" > combined_file.txt

# 替换原文件
mv combined_file.txt "$target_file"

echo "文件内容已成功拼接，并保存到 $target_file"

说明：

• 这个脚本会将 2.txt 的每一行与 Rattus_basic_info.txt 的对应行合并，中间用制表符分隔。
• 如果 2.txt 的行数少于 Rattus_basic_info.txt 的行数，剩余的行会被保留并填充空白。
• 如果你不希望覆盖原文件，请确保在运行之前备份原文件。

这个方法确保了文件内容按行合并，并且使用了指定的制表符作为分隔符。

二、方法二

要使用 Python 脚本将 2.txt 文件的内容按行拼接到 /home/SunlabSharedFolder/shun/LncRNA_ORF_region_0806/info/Rattus_basic_info.txt 文件的每一行后面，并使用制表符作为分隔符，可以参考以下的 Python 脚本：

# 定义文件路径
target_file = '/home/SunlabSharedFolder/shun/LncRNA_ORF_region_0806/info/Rattus_basic_info.txt'
source_file = '2.txt'
output_file = '/home/SunlabSharedFolder/shun/LncRNA_ORF_region_0806/info/Rattus_basic_info_combined.txt'

# 打开文件
with open(target_file, 'r', encoding='utf-8') as tf, open(source_file, 'r', encoding='utf-8') as sf:
    target_lines = tf.readlines()
    source_lines = sf.readlines()

# 确保两个文件的行数一致，如果不同，使用空字符串填充
max_len = max(len(target_lines), len(source_lines))
target_lines += [''] * (max_len - len(target_lines))
source_lines += [''] * (max_len - len(source_lines))

# 逐行拼接，并使用制表符作为分隔符
combined_lines = [t.strip() + '\t' + s.strip() for t, s in zip(target_lines, source_lines)]

# 将结果写入新的文件
with open(output_file, 'w', encoding='utf-8') as of:
    of.write('\n'.join(combined_lines) + '\n')

print(f"文件内容已成功拼接，并保存到 {output_file}")

脚本说明：

1. 文件路径：

   • target_file 是目标文件的路径 (Rattus_basic_info.txt)。
   • source_file 是需要拼接的文件路径 (2.txt)。
   • output_file 是保存拼接后结果的文件路径。

2. 读取文件：

   • target_lines 和 source_lines 分别读取 target_file 和 source_file 中的所有行。

3. 行数对齐：

   • 如果两个文件的行数不一致，脚本会使用空字符串填充较短的文件，以确保行数对齐。

4. 拼接内容：

   • 使用 zip 函数将两组行按行拼接，strip() 去除行末的换行符，'\t' 用作分隔符。

5. 写入文件：

   • 拼接后的结果被写入 output_file。

6. 输出信息：

   • 脚本完成后，会打印一条消息，告诉你拼接后的文件已保存。

执行脚本：

你可以将上述脚本保存为 merge_files.py，然后在终端中运行以下命令来执行它：

python merge_files.py

执行完成后，拼接后的内容将被保存到 Rattus_basic_info_combined.txt。如果你想直接覆盖原文件，可以将 output_file 变量的路径设为 target_file。