字符串匹配算法题：病毒感染监测

（1）描述：医学研究者最近发现了某些新病毒，通过对这些病毒的分析，得知它们的DNA序列都是环状的。现在研究者收集了大量的病毒DNA和人的DNA数据，想快速检测出这些人是否感染了相应的病毒。为方便研究，研究者将人的DNA和病毒的DNA均表示成由一些小写字母组成的字符串，然后检测某种病毒的DNA序列是否在患者的DNA序列中出现过，如果出现过，则此人感染了病毒，否则没有感染。注意：人的DNA序列是线性的，而病毒的DNA序列是环状的。

（2）输入：多组数据，每组数据有一行，为序列A和B，A对应病毒的DNA序列，B对应人的DNA序列。A和B都为“0”时输入结束。

（3）输出：对于每组数据输出一行，若患者感染了病毒输出“YES”，否则输出“NO”。

思路：

先写一个BF算法作为匹配字符串的函数

对于循环的字符串，只需要另外写一个分解字符串的方法，把每一种情况的字符串都放入BF算法中与人类DNA字符串进行匹配，最后在main函数中判断结果。

源代码:

#include <stdio.h>
#include <string.h>
#include <stdlib.h>
typedef struct
{
	char x[20];
	char y[50];
}dna;

typedef struct
{
	dna arr[20];
}list;


int test(char x[],char y[])  //BF算法
{
	int flag;
	int i=0,j=0;
	int lenx=strlen(x);
	int	leny=strlen(y);
	
	while(i<lenx&&j<leny)
	{
		if(x[i]==y[j])
		{
			i++;
			j++;
		}
		else
		{
			i=i-j+1;
			j=0;
		}
	}
	if(j>=leny) return 1;
	else return 0;
}

int divide(char x[],char y[],int k)  //分解字符串为循环子串 
{
	char str[100];
	int len=strlen(x);
	int i=k;
	int pos=0;
	int count=0;
	int flag=0;

		while(true)
		{
		
			if(i>len-1)
			{
				i=0; 
			}
			str[pos]=x[i];
			i++;
			pos++;
			count++;
			if(count==len)
			{
				flag=1;
				break;
			}	
		}
	//t	printf("%s\n",str);
		if(flag)	return test(y,str);
		else 		return 0;
		
}
int main()
{
	list l;
	int i=0;
	while(true)
	{	
	//	printf("请依次输入病毒DNA序列，人DNA序列：\n");
		scanf("%s %s",l.arr[i].x,l.arr[i].y);
		if(strcmp(l.arr[i].x,"0")==0&&strcmp(l.arr[i].y,"0")==0)
		break;
		i++;	
	}
	

	int count1=1;
	int count2=1;
	int temp=0;
	for(int index=0;index<i;index++)
	{
		int len_x=strlen(l.arr[index].x);
	//	printf("%d\n",len_x);
		if(count1<len_x)
		{
			for(int k=1;k<=len_x-1;k++)
			{
				temp=divide(l.arr[index].x,l.arr[index].y,count2);
			//	printf("%d\n",temp);
				count2++;
			}
		//	printf("test:%d \n",test(l.arr[index].x,l.arr[index].y));
			if(test(l.arr[index].y,l.arr[index].x)||temp)
				printf("YES\n");
			else
				printf("NO\n");
		}
		count1=1;
		count2=1;
		
	}
	
	return 0;
 }