使用distance.squareform时进行向量矩阵转换以及出现“The matrix argument must be square“报错的解决方案

最新推荐文章于 2021-09-01 16:33:20 发布
最新推荐文章于 2021-09-01 16:33:20 发布
阅读量1k 收藏
点赞数
分类专栏： Python数据处理 文章标签： python 数据分析
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/weixin_46523923/article/details/118281132
版权

在计算相似性问题时，没两个样本之间计算距离，可以产生一个nn的相似性矩阵，其中共有n(n-1)/2个不重复的相似性。因此为了便于储存，我们通常将其储存成为向量形式，节省储存空间和读取速度。
我这里使用了4103个样本，于是计算得到了8415253维的向量，在读取后，我需要重新获取完整的相似性矩阵，从而进行谱聚类。于是我使用pd.read_csv读取相似性向量，获得一个8415253*1的Dataframe格式的变量。
在这里插入图片描述使用distance.squareform()函数进行矩阵变换时，却出现了报错

Haar_simi1 = distance.squareform(Haar_simi_)

“The matrix argument must be square”
在这里插入图片描述
我重新计算了向量长度，发现并没有问题，那么是数据格式的问题吗？
我使用np.array将其转换成1维数组，却依旧报错。
在这里插入图片描述
我尝试了很多种方法，最终发现，该函数支持serie格式的数据，于是我将其转换成了Series类型，终于实现了成功的矩阵变换，转换成了4103*4103的相似性矩阵
在这里插入图片描述在这里插入图片描述
将一维Dataframe转换成Series可以使用pd.Series()进行，或者也可以直接进行如下这样一个乘1的运算来获得。

Haar_simi_ = Haar_simi_.iloc[:,0]*1
feiGeorge
关注
专栏目录
InvalidArgument-The argument is invalid(解决方案).md
08-29
InvalidArgument-The argument is invalid(解决方案).md
scipy.spatial.distance.squareform的使用
qq_41000421的博客
11-28 1331
scipy.spatial.distance.squareform a1 Out[118]: array([[ 0, 2, 3, 4], [ 2, 0, 7, 8], [ 3, 7, 0, 12], [ 4, 8, 12, 0]]) a=dist.squareform(a1) 首先是a1如果是矩阵的话就必须对称 ，一般是距离矩阵，对角线元素都为0，a=dist.squarefo...
python语法错误 'q' must be a 'd' matrix with one column
夏夜蒲扇的博客
03-06 4734
代码： from cvxopt import solvers, matrix P=matrix([[2,1],[1,2]]) q=matrix([2,1]) G=matrix([[-1,0],[0,-1]]) h=matrix([1,1]) A=matrix([1,1],(1,2)) b=matrix(1) solvers.options['show_progress'] = False so...
MATLAB基础
自深深处
11-05 1616
>> 5^2ans = 25>> COS(pi) Undefined function 'COS' for input arguments of type 'double'.Did you mean: >> cos(pi)ans = -1>> x=[1 2 3 4 5]; >> y=[10 20 30 40 50]; >> plot(x,y) >> isvarname timeans =
scipy.spatial.distance.squareform
gaoxiaobai666666的博客
04-08 621
这个借口主要有两种功能，一种是给出一个反应点和点之间的距离矩阵，然后返回所有点和点之间距离的一维数据。例如： w是一个10乘10的矩阵，w[1,2]的值为点1和点2之间的距离（公共点的索引为0-9).w[1,2]的值其实就是h[ 的值。它们之间的转换就是由这个公式转换来的。其中在这个例子中n就等于10. n的计算方法为.另外一个功能就是将h转换为类似w的一个反应点和点之间距离的矩阵...
二、模型评估
堵心好似八局
07-23 1899
二、模型评估 #没有测量，就没有科学 #在机器学习领域中，对模型的评估至关重要。只有选择与问题相匹配的评估方法，才能快速地发现模型选择或训练过程中出现的问题 #模型评估主要分为离线评估和在线评估两个阶段。 #针对分类、排序、回归、序列预测等不同类型的机器学习问题，评估指标的选择也有所不同。知道每种评估指标的精确定义、有针对性地选择合适的评估指标、根据评估指标的反馈进行模型调整，都是机器学习在模型评估阶段的关键问题 #模型评估指标的局限性 知识点： [1] 准确率（Accuracy） [2] 精确率（Pre
Django生成数据库及添加用户报错解决方案
12-16
Django生成数据库表时报错 __init__() missing 1 required positional argument: ‘on_delete’ 原因： 　在django2.0后，定义外键和一对一关系的时候需要加上on_delete选项，此参数为了避免两个表里的数据不一致...
Android模拟器无法启动,报错：Cannot set up guest memory ‘android_arm’ Invalid argument的解决方法
09-02
然而，有时我们可能会遇到模拟器无法启动的问题，报错信息为“Cannot set up guest memory ‘android_arm’ Invalid argument”。这个错误通常意味着模拟器在尝试分配内存时遇到了问题，可能是由于系统资源不足或者...
python使用ddt过程中遇到的问题及解决方案【推荐】
12-23
在使用DDT数据驱动+HTMLTestRunner输出测试报告时遇到过2个问题： 1、生成的测试报告中，用例名称后有dict() -> new empty dictionary 2、使用ddt生成的用例名称无法更改 1、用例名称后有dict() -> new empty ...
解决Python中报错TypeError: must be str, not bytes问题
09-17
### 解决Python中报错TypeError: must be str, not bytes问题 #### 一、问题背景与常见场景 在Python编程过程中，尤其是处理文件操作时，可能会遇到“TypeError: must be str, not bytes”这一错误。这通常发生在...
colMedians(x) : Argument ‘x’ must be a matrix、rowMedians(data) : Argument ‘x‘ must be a matrix.
data+scenario+science+insight
09-01 898
colMedians(x) : Argument ‘x’ must be a matrix、rowMedians(data) : Argument 'x' must be a matrix. 目录 colMedians(x) : Argument ‘x’ must be a matrix、rowMedians(data) : Argument 'x' must be a matrix. 问题： 解决： 完整错误： 问题： #仿真数据 set.seed(1234) .
Python代码问题之——matrix must be 2-dimensional问题解决
张琪的博客
03-14 3万+
1、问题发现     今天在处理服从泊松分布的随机数时遇到了问题。     首先，用循环直接生成了一个3*4阶的矩阵，所有数都服从均值为5的泊松分布。代码如下： x = [] d=4# 矩阵列数为d d天 z=3#矩阵行数为z z个采集点位 for i in range(0, z): #矩阵行数为z ...
matlab中squareg,matlab中y=square(t,DUTY)的用法
weixin_33218985的博客
03-17 1286
matlab中y(:,y(:,1:y(:,k)表示取数组y中第k列的所有元素；类似的,y(:,1:8)指取y中1到8列的所有元素.两边没有数的冒号表示所有行的意思请问 MATLAB 中square 的用法?周期性矩形脉冲信号MATLAB语言调用形式:y=square(t,duty)产生一个周期为2π,幅值为±1的周期性方波,duty表示占空比(dutycycle)t=-0.0625:0.0001:...
scipy中squareform函数详解
counsellor的专栏
03-14 1万+
函数格式 scipy.spatial.distance.squareform(X, force=’no’, checks=True) 函数定义 Converts a vector-form distance vector to a square-form distance matrix, and vice-versa. 解释 用来把一个向量格式的距离向量转换...
Scipy教程 - 距离计算库scipy.spatial.distance
热门推荐
皮皮blog
09-29 6万+
http://blog.csdn.net/pipisorry/article/details/48814183在scipy.spatial中最重要的模块应该就是距离计算模块distance了。距离计算矩阵距离计算函数矩阵参数每行代表一个观测值，计算结果就是每行之间的metric距离。Distance matrix computation from a collection of raw obser
Matlab函数—pdist、squareform
sunny的专栏
07-04 1万+
1.pdist函数 最近开始用matlab做一些算法，用到pdist()函数，发现网上很多的文章讲得不是太明白，我主要对pdist()的具体实现过程用例子的方式进行详述。 D = pidst(X)主要计算X的行的距离，例如输入X为m*n的矩阵，输出D为m*(m-1)/2的向量，计算方法如下例子： X=[1,2;3,4;5,1] 3*2的矩阵; pdist(X)计算结果为[2.8284,4....
矩阵的求职matlab,matlab中的矩阵
weixin_39958019的博客
03-25 186
matlab中的矩阵我们知道,求解线性方程组是线性代数课程中的核心内容,而矩阵又在求解线性方程组的过程中扮演着举足轻重的角色。下面我们就利用科学计算软件MATLAB来演示如何使用矩阵,同时,也使学生对线性代数的认识更加理性。一、矩阵的构造在MatLab中,构造矩阵的方法有两种。一种是直接法,就是通过键盘输入的方式直接构造矩阵。另一种是利用函数产生矩阵。例1.利用pascal函数来产生一个矩阵A=p...
Maximal Square
不积跬步无以至千里
05-09 514
二维数组的动态规划、找到一个二维矩阵中由1组成的最大的正方形的面积。
matlab错误打印,Matlab   运行错误提示
weixin_29548281的博客
03-16 1177
Matlab运行错误提示(2010-04-03 17:43:09)1. Assignment statements do not produce results.赋值语句不会产生结果，通常是把==写成了=2. Capitalized internal function xxx; Caps Lockmay be on.拼写错误或者大写开关打开3. Function definitions ar...
Invalid datatype. Options argument must be created with OPTIMOPTIONS. 编写matlab代码时出现这种报错情况是怎么回事
最新发布
09-07
这个错误提示“Invalid datatype. Options argument must be created with OPTIMOPTIONS”通常出现在使用MATLAB的优化工具箱中的函数时。这个错误表明传递给该函数的选项参数（Options argument）不是通过`optimoptions`函数创建的。`optimoptions`是用于创建和修改各种优化函数选项结构体的函数，它是MATLAB优化工具箱中用于自定义函数行为的重要工具。 例如，当你使用`fmincon`、`fminunc`、`lsqnonlin`等优化函数时，你可以通过`optimoptions`来设置优化算法、容忍度、显示选项等参数。如果直接传递了未经`optimoptions`创建的选项字典或者其他数据类型，就会出现上述错误。 解决这个问题的方法是确保你创建了正确的选项结构体。下面是一个使用`optimoptions`的基本示例： ```matlab % 假设我们要使用fmincon函数进行优化 % 首先，创建一个默认的选项结构体 options = optimoptions('fmincon'); % 然后，可以修改一些选项，例如算法类型 options.Algorithm = 'sqp'; % 现在，我们可以将修改后的options结构体作为参数传递给fmincon函数 [x, fval] = fmincon(@myfun, x0, A, b, Aeq, beq, lb, ub, nonlcon, options); ``` 在上述代码中，`@myfun`是你定义的优化目标函数，`x0`是优化变量的初始值，其余参数是线性不等式和等式约束、变量的下界和上界以及非线性约束函数。`optimoptions('fmincon')`创建了一个针对`fmincon`函数的默认选项结构体，然后我们修改了算法类型为`sqp`。最后，我们将这个配置好的`options`结构体传递给`fmincon`函数。
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

feiGeorge

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付：¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足，请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值