R语言 各种logistic回归 普通 条件 IPTW

最新推荐文章于 2024-08-09 22:30:04 发布
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#【普通logistic回归】
library(reportReg)
Match$SYPL <- as.factor(Match$SYPL)
model0=glm(zq101~SYPL,data=Match,family=binomial(),)
reportReg(model0)
summary(model0)

#【IPTW的logistic回归】
data$SYPL <- as.factor(data$SYPL)
model1=glm(zq101~SYPL,data=data,family=binomial(),weights=mw1)
reportReg(model1)

#【PSM】的【条件logistic回归】
??clogit
library(survival)
model2 <- clogit(zq101~SYPL + strata(group), data=Match)
reportReg(model2)
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R语言条件Logistic回归模型案例:研究饮酒与胃癌的关系
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R语言条件Logistic回归模型案例:研究饮酒与胃癌的关系 目录 R语言条件Logistic回归模型案例:研究饮酒与胃癌的关系 #样例数据 #条件Logistic回归模型 #样例数据 id outcome exposure 1 1 1 1 0 1 2 1 1 2 0 1 3 1 1 3 0 1 4 1 1 4 0 0 5 1 1 5 0 0 6 1 1 6 0 0 7 1 1 7 0 0 8 1 1 8 0 0 9 1 1 9 0 0 10 1 1 #条...
R语言-logistic回归
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【代码】R语言-logistic回归。
辩证看待倾向性评分法
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倾向性评分匹配法（Propensity Score Matching，PSM）是临床观察性研究中经常使用的一种控制混杂偏移的技巧。其出现的背景是：需要控制的混杂变量很多，采用分层法控制偏移会导致样本量严重缩水，因而采用一种替代的可以近似控制混杂因素的方法。 混杂因素 混杂因素（即混杂变量，confounding variables）的定义和条件如下（摘自百度百科）： 混杂因素是指与研究因素...
基于R语言3组以上倾向评分逆概率加权(IPTW)
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基于 PS （倾向评分）的IPTW 法首先由Ｒosenbaum作为一种以模型为基础的直接标准化法提出，属于边际结构模型。简单来说，就是把许多协变量和混杂因素打包成一个概率并进行加权，这样的话，我只用计算它的权重就可以了，方便了许多。那么，如何将多个协变量的影响用一个倾向评分值来表示呢? 即如何估计倾向评分值呢? 根据 Rosen-baum 和 Rubin 的定义:倾向评分值为在给定一组协变量(X i )条件下，研究对象 i(i =1，2，…N)被分配到某处理组或接受某暴露因素(Z i =1)的条件概率。理论
条件logistic回归及R实现
Christina
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library(survival) resp <- levels(logan$occupation) n <- nrow(logan) indx <- rep(1:n, length(resp)) logan2 <- data.frame(logan[indx,], id = indx, tocc = factor(rep(resp, each=n))) logan2$case <- (log.
代码+视频手把手教你基于R语言逆概率加权(IPTW)并行生存曲线分析
dege857的博客
01-09 1487
逆概率加权法最早由 Ｈｏｒｖｉｔｚ和Ｔｈｏｍｐｓｏｎ提出，即对每个可观测的ｙi的概率取倒数，作为被观测的 yi 的权重，修正由缺失数据或有偏抽样带来的估计偏差.IPTW 是减少多组观察性数据间混杂偏倚的有效方法, 在处理多组间变量混杂偏倚中起到了重要作用。简单来说，就是把许多协变量和混杂因素打包成一个概率并进行加权，这样的话，我只用计算它的权重就可以了，方便了许多。代码+视频手把手教你基于R语言逆概率加权(IPTW)并行生存曲线分析。
R语言条件逻辑回归-因变量是配对资料
医学和生信笔记的博客
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完美观看体验请至公众号查看本文。，专注R语言在临床医学中的使用，R语言数据分析和可视化。
SPSS进行倾向评分逆概率加权（IPTW）
dege857的博客
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基于 PS （倾向评分）的IPTW 法首先由Ｒosenbaum作为一种以模型为基础的直接标准化法提出，属于边际结构模型。简单来说，就是把许多协变量和混杂因素打包成一个概率并进行加权，这样的话，我只用计算它的权重就可以了，方便了许多。那么，如何将多个协变量的影响用一个倾向评分值来表示呢? 即如何估计倾向评分值呢? 根据 Rosen-baum 和 Rubin 的定义:倾向评分值为在给定一组协变量(X i )条件下，研究对象 i(i =1，2，…N)被分配到某处理组或接受某暴露因素(Z i =1)的条件概率。理论
使用R语言进行logistic回归分析（1）
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02-23 1674
本例中某种药物有效为1，无效为0，即某种药物的治疗效果y取值为1或0，p为某种药物有效的概率，E(y)=p即是变量y的期望。自变量为病情的轻重，轻为1，重为0，本例已给出病情轻重的样本数据，本例回归模型即是f(E(y))=β。因此定义y1,y2,y3分别为某种药物的治疗的效果，取值为1或0，有效为1，无效为0，定义x1,x2,x3分别为每种药物下实验下病情轻重样本数据，也用1和0表示。某研究者欲比较3种不同的药物治疗病情不同的某病的效果，研究数据见上表，试对数据进行logistic回归，并进行统计推断。
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但是，当我们创建最终模型时，我们只想排除那些在最终模型中实际包含的变量中具有缺失值的观察样本。为了测试最终模型的整体p值，绘制最终模型，或使用glm.compare函数，我们将创建一个名为Data.final的数据框，只排除那些观察结果。例如，如果两个独立变量彼此相关，可能在最终模型中都不需要这两个变量，但可能有理由选择一个变量而不是另一个变量。通常建议不要盲目地遵循逐步回归程序，而是要使用拟合统计（AIC，AICc，BIC）比较模型，或者根据生物学或科学上合理的可用变量建立模型。deviance残差。
R语言logistic回归分析
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代码+视频R语言3组以上倾向评分逆概率加权(IPTW)
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PS为观察单位的倾向评分值。后台有粉丝问，怎么使用R进行3组以上的倾向评分逆概率加权（IPTW），看了上面内容我们就明白，只要知道每组数据的倾向评分（也就是概率），根据公式转成权重数就可以了，和做两组的步骤基本一样，今日咱们来演示一下语言3组以上倾向评分逆概率加权(IPTW)。综上所述：倾向评分加权法首先将多个主要混杂变量的信息综合为一个变量倾向评分 ,然后将倾向评分作为需要平衡的混杂因素 ,通过标准化法的原理加权,使各对比组中倾向评分分布一致 ,则达到使各混杂因素在各比较组分布一致的目的。
【R语言实战】——Logistic回归模型
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R语言倾向性评分：加权
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之前已经介绍过。(inverse probability weighting, IPW)和倾向性评分加权的方法有很多，常见的一些加权方法比较如下：常见加权方法其中ATE就是大家比较常见的IPW方法，还有一种常见的，是这里的ATT。前者是针对所有研究对象，后者是针对病例组。
R语言使用glm构建logistic回归模型，构建多个协变量和分组变量之间的关系模型进行倾向性评分计算、使用predict函数预测倾向性评分并将结果整合到dataframe中
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R语言使用glm构建logistic回归模型，构建多个协变量和分组变量之间的关系模型进行倾向性评分计算、估计(Propensity score)、使用predict函数预测倾向性评分并将结果整合到dataframe中
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代码+视频R语言绘制逆概率加权后的基线表
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基于 PS （倾向评分）的逆概率加权(IPTW )法首先由Ｒosenbaum作为一种以模型为基础的直接标准化法提出，属于边际结构模型。简单来说，就是把许多协变量和混杂因素打包成一个概率并进行加权，这样的话，我只用计算它的权重就可以了，方便了许多。那么，如何将多个协变量的影响用一个倾向评分值来表示呢?根据 Rosen-baum 和 Rubin 的定义:倾向评分值为在给定一组协变量(X i )条件下，研究对象 i(i =1，2，…N)被分配到某处理组或接受某暴露因素(Z i =1)的条件概率。
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