统计学意义只是起点。

一键生成版本 （找工作去了，不改了）# 1. 下载数据与json文件# 2. 不同文件夹文件提取# 将次级目录的文件夹里面的文件提取到同一个文件夹下# 一些基础操作list.files(pattern = "\\.tsv") #当前目录显示以tsv结尾的文件dir()dir(all.files=TRUE) #显示隐藏的文件getwd()# 验证二级文件夹里面是否有文件，无返回NA值，为TRUE，filename=1for (i in 1:200) { a=as.char

TCGA转录组Table合成时间 2022.5.5下载数据与json文件然后打开TCGA新转录组.R不同文件夹文件提取将次级目录的文件夹里面的文件提取到同一个文件夹下# 一些基础操作list.files(pattern = "\\.tsv") #当前目录显示以tsv结尾的文件dir()dir(all.files=TRUE) #显示隐藏的文件getwd()# 验证二级文件夹里面是否有文件，无返回NA值，为TRUE，filename=1for (i in 1:200) {

list.files(pattern = "\\.tsv")dir()dir(all.files=TRUE)dir()getwd()filename=1for (i in 1:20) { a=as.character(list.files(list.files()[i])[1]) ifelse( a%in% NA==TRUE, NA,'b') b=paste(getwd(),"/",list.files()[i],"/",list.files(list.files()[i]

list.files(pattern = "\\.csv")dir()dir(all.files=TRUE)dir()getwd()filename=1for (i in 1:20) { a=as.character(list.files(list.files()[i])[1]) ifelse( a%in% NA==TRUE, NA,'b') b=paste(getwd(),"/",list.files()[i],"/",list.files(list.files()[i]

apply(data, 2, function(x){gsub(pattern = ".*(替换字符).*", replacement = "\\2替换为",x) })

使用本地数据 鸢尾花（yuān wěi huā）初探线性混合模型Linear Mixde Model施工ing 交互作用的#载入示例数据data(iris)#载入包library(tidyverse) library(lme4) #生成个体idiris$ID <- rep(1:30,each=5) #假设一朵花测五次iris$ID <- as.factor(iris$ID)#-------------【ANOVA】------------iris_aov1<

t分布的推导那我们来写写代码，实践这个过程。我设定一个总体均数为0，标准差=1，样本量为1000的人群（图A是这个总体的概率分布）。图B，也是一次抽取三个人，抽了200个，图C一次抽取6个人。都分别计算t值。我们看到图C，一次抽取6个人，分布更多集中在总体均数为0。 还有一个，问题，图B中画绿框的这一部分，怎么解释呢？课后可以想想。（1.抽样误差、2.开端的，无闭合）继续写代码实践，。如一次，，，他们分布会有什么特点。从图片可以得出什么规律：发现一次抽取3次和一次抽取6次比。一次抽取3次的曲线更低，向

RT

学习资料/开发者Github-yrosseel/lavaan

MatchIt包进行倾向性评分匹配法(Propensity Score Matching, PSM)主要是1：N匹配。一个病例对应2个对照等。MatchIt包帮助文档MatchIt.pdf1：1匹配也可以参考逆概率加权笔记IPTW结果分析采用条件logistic回归#加载包library(tableone)library(MatchIt)#加载数据data <- read.csv("测试数据.csv")names(data)#多变量因子化data[,4:18]<-lappl

stack Overflow上面的讨论提及： nnet包 、 mlogit包、glm施工ing建议直接在SPSS操作 医咖会参考

GitHub-knights-lab/BugBase 提供大部分 革兰氏阳性 革兰氏阴性 需氧菌 厌氧菌 兼性厌氧菌的信息【我已经稍加整理，在本博客资源可以下载】自己的Feature Table如何有些物种没有的话，可以在下面两个网站查询补充下。NCBI的Taxonomy原核生物标准命名列表...

ggplot2 多箱图 多个箱线图 分组箱线图使用本地数据 鸢尾花（yuān wěi huā）做示例结果输出如下面的图data(iris) #用本地数据 鸢尾花（yuān wěi huā）做示例data <- iristable(data$Species)data <- data[data$Species==c ("setosa", "versicolor"),]table(data$Species) #选取两种花为两个分组#加载需要的包library(simplevis)

Rstudio 新版本2021.09.2 中文路径识别不了 、中文命名的数据文件识别不了/乱码Tab键导入数据时候，本地文件名中文识别乱码怎么修复呢？我之前的xls和csv文件名有中文都是正常的，识别，可以导入。这次系统重装后，不行了？？？。安装回来我之前的Rstudio版本 我上次是2020.2买电脑安装的，对于应该是1.3.1093这个OK了 能正确识别了...

CLRComponent logarithmic conversion 成分对数转换Centered log-ratio transformation 中心对数转换数据要求：行=OTU/基因 列=样本require(qiime2R)#Samples are columns data_clr=make_clr(data)

笔记本恢复如何重新注册office需要登入当初注册的邮箱，然后登入microsoft网站，下载相应的office版本

R语言 基于系统自带的base进行数据框的一些操作不加载library(tidyverse)#对变量进行排序#找变量位置#对数据库某个变量的标签进行替换(数值)#。。。。。。。。。。。。。替换(字符)#筛选男性数据#筛选老年男性数据data <- data[order(data$Var), ] #对变量进行排序which(names(data)=='age') #找变量位置data$Var[data$var == 1] <- 2 #对数据库某个变

前面的分析看之前，或者其他资源的绘制logisitc回归的风险预测值的nomogram图nom <- nomogram(f1, fun=plogis, lp=F, funlabel=“Risk”)plot(nom)单个患者列线图得分dd <- nomdata #nomdata就是你刚才做nomogram的数据da <- datadist(dd)option <- options(datadist=“da”)library(nomogramFormula)resul

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