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原创 R包gbmt轨迹模型指标计算的函数

【代码】R包gbmt轨迹模型指标计算的函数。

2025-05-17 22:03:44 288

原创 【R语言】删掉几个变量全部为缺失值的行

dfV1 V2 V3df2V1 V2 V3df3V1 V2 V3。

2025-05-12 20:47:07 120

原创 【LCMM】纵向轨迹模型,组轨迹模型

【代码】【LCMM】纵向轨迹模型,组轨迹模型。

2025-04-26 14:59:12 211

原创 [CHNS]缺失补充方法

吸烟、饮酒、等问卷也可以将, Idind 和 Wave 排序后,进行补充…因为有多个调查Wave, 借助其他调查年的情况,特别是有多次调查的,

2025-04-19 08:36:25 167

原创 [CHNS] 膳食分层分析

中国健康与营养调查(China Health and Nutrition Survey,CHNS)

2025-04-18 07:40:25 234

原创 【CHNS】pexam_pub_12.sas7bdat 最重要的文件有的变量

U: 1-2、5-6、9-10=城市3、4、7、8、11-12=次级/农村:1、5、9=总人口2、4、6、8、10-12=农村。U: 1-2=城市编号/R:1-4=县编号。过去12个月:胸部有吹口哨/喘息吗?1=城市场地(U)2=农村场地(R)首次诊断为中风或脑缺血发作的年龄?16岁以下:孩子有肌肉/神经缺陷吗。胸口有口哨声/喘息声,多少年了?曾经受伤或失去至少两周的工作吗?你几岁的时候认识的。酒:梁(50克)每周喝一杯。LYR:喝软/含糖水果饮料。16岁以上:有毛囊角化病吗。16岁以下:孩子有方头吗?

2025-04-17 14:36:24 660

原创 【CHNS】随访时间 整理

【代码】【CHNS】随访时间 整理。

2025-04-14 20:46:06 196

原创 【CHNS】 各个文件,数据信息备注

年龄和调查年的信息。

2025-04-14 20:38:26 742

原创 【CHNS】感知压力Perceived Stress

PSS的总分是通过将阳性项目的得分反转,然后在所有项目上求和而获得的,得分越高,表示感知到的压力越高。

2025-04-12 10:21:33 146

原创 【孟德尔随机化】1400代谢组学分类

这1099种代谢物包括与脂质代谢(n=548,49.9%)、氨基酸代谢(n=215,19.6%)、外源性物质代谢(n=163,14.8%)、肽代谢(n=42,3.8%)、核苷酸代谢(n=42,3.8%)、辅因子和维生素代谢(n=38,3.5%)、碳水化合物代谢相关的9类生化小分子(n=25,2.3%)、部分表征分子(n=16,1.5%)和能量(n=10,0.9%)(补充数据1)。

2025-04-08 16:49:02 419

原创 【统计方法】LASSO筛变量

​​标准化数据​​:LASSO 对特征的尺度敏感,需对数据进行标准化(均值为0,方差为1)。cv.glmnet​获得的lambda.min 或者 lambda.1se 传递给。比较原始做LASSO包是。

2025-04-04 22:53:37 574

原创 [mlr3] Resample的AUC结果和benchmark不一致?

都是采用boostrap。

2025-03-29 20:28:29 115

原创 [mlr3] Bootstrap与交叉验证k-fold cross validation

实际应用中,可结合两者优势:用交叉验证调参,再用Bootstrap评估模型参数的置信区间。因有放回抽样的重复性和验证集的不稳定性,主要服务于。因其无放回分层抽样和重复验证机制,成为。参数估计(置信区间的计算)

2025-03-29 09:06:42 283

原创 【mlr3】filter函数

接受一个整数向量,表示要保留的迭代编号。:保留第1、3、5次迭代。:仅保留第2次迭代。

2025-03-27 09:41:20 384

原创 【mlr3】instantiate函数

【代码】【mlr3】instantiate函数。

2025-03-27 09:13:45 322

原创 流行病学计算

调查人群无该年龄层,也不允许删除。主要来自结果数据计算。

2025-03-23 17:35:11 276

原创 【孟德尔随机化】Leave-one-out analysis的异常点,判断

2025-03-16 19:58:59 379

原创 Python像 R一样,一行一行执行

python

2025-03-12 14:46:24 212

原创 【孟德尔随机化】PhenoScanner不能用的,替代方法

【代码】【孟德尔随机化】PhenoScanner不能用的,替代方法。

2025-03-06 20:15:34 428

原创 【流行病学】Melodi-Presto因果关联工具

1SemMedDB 大型开放式知识库。

2025-03-04 14:53:26 518

原创 【宏基因组】MaAsLin2

【代码】【宏基因组】MaAsLin2。

2025-02-21 16:57:35 196

原创 不同安装路径重复R包清理

R语言环境

2025-02-21 16:41:08 520

原创 【Python】endote参考文献格式获取,从PubMed

【代码】【Python】endote参考文献格式获取,从PubMed。

2025-01-19 22:24:08 183

原创 宏基因组,物种进化树LDA,lefse

【代码】宏基因组,物种进化树LDA,lefse。

2025-01-04 21:49:50 176

原创 【R语言】校准曲线,绘制原理

【代码】【R语言】校准曲线,绘制原理。

2025-01-01 15:19:48 788

原创 【R语言】boolean的的运算TRUE=1, FALSE=0

TRUE 为 1FAlSE 为 0

2024-12-30 20:40:50 646

原创 Metagenome宏基因组,未识别的物种unclassified

不可以在OTU/ASV表中直接删掉不可以在OTU/ASV表中直接删掉。

2024-12-29 21:38:19 594

原创 CHNS 膳食数据清洗, 个人膳食摄入+家庭

【代码】CHNS 膳食数据清洗, 个人膳食摄入+家庭。

2024-12-25 09:19:42 1230 10

原创 R语言,剪切板双向转,临时处理数据

【代码】R语言,剪切板双向转,临时处理数据。

2024-12-25 09:08:41 530

原创 NHANES数据库,CVD判断

【代码】NHANES数据库,CVD判断。

2024-12-24 21:40:46 320

原创 mlr3超参数Hyperparameter 自动寻找auto

【代码】mlr3超参数。

2024-12-20 21:30:46 367

原创 mlr3机器学习bench置信区间AUC

p1=autoplot(bmr, type = “roc”) # 去掉置信区间p1$data 是聚合的结果,可以单个CV的作图结果在合并在一起画类似上面的 df_p_x_cv_rf不会改变已设置超参数的学习器ROC曲线禁止平滑化,如果要得到平滑的AUC/ROC曲线,采用CV策略,repeats=5 fold= 5,把结果提取出来,重新导入作图,获取aggregate可以直接获取的AUC 和95CI,靠自己rr$score(msr(“classif.auc”)) 提取计算, 可以算置信区间。Rmis

2024-12-20 21:25:44 362

原创 mlr3机器学习AUC的置信区间提取

roupdfroupdfA)

2024-12-18 22:10:04 482

原创 shiny_插入图片

【代码】shiny_插入图片。

2024-02-18 09:26:31 363

原创 【R语言】Environment环境数据的删除

【代码】【R语言】Environment环境数据的删除。

2022-10-25 10:27:11 8418

原创 【PASS】析因设计样本量计算

【PASS】析因设计样本量计算

2022-10-24 10:35:23 1601 1

原创 【R语言】方差分析

【代码】【R语言】方差分析。

2022-10-23 16:41:26 847

原创 【R语言】多项式逻辑回归logistic

【代码】【R语言】多项式逻辑回归logistic。

2022-10-23 16:34:14 2254

原创 hugo个人博客 even主题美化记录

hugo个人博客 even主题美化记录

2022-10-21 10:54:19 950

原创 [公共数据库] NHANES leisure 业余活动分类处理

【代码】[公共数据库] NHANES leisure 业余活动分类处理。

2022-10-07 10:26:50 804

Rstudio-Cheatsheets速查表【推荐的基础部分】

Rstudio-Cheatsheets速查表【推荐的基础部分】

2022-11-02

NetCoMi-1.0.2.tar.gz

NetCoMi-1.0.2.tar.gz

2021-11-28

DESeq2示例文件的原始数据.csv

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2021-09-15

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