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原创 2021-01-18

pip安装换源清华开源软件镜像站临时使用pip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple some-package设为默认pip install pip -Upip config set global.index-url https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple临时使用镜像升级pippip install -i https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple

2021-01-18 09:52:10 105

原创 conda+jupyter安装过程及注意事项

conda 安装(服务器)服务器下载把conda(miniconda)下载至本地,再上传至服务器miniconda[conda]直接用wget命令下载至服务器wget -c https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-4.4.10-Linux-x86.sh清华/科大镜像源(解决下载慢问题)conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/p

2020-09-08 10:56:40 3167

原创 Augur安装与使用

Augur是一个生物信息学工具,与auspice(可视化应用程序)结合使用进行序列比对和系统发育树的构建。

2020-07-30 20:57:02 1699

原创 Bioinfomatic

Bioinfomatic什么是生物信息学?概念生物信息学就是用计算机解决生物学问题研究对象学什么?生物数据库生物数据库收集——查看——整理生物数据库分类常用PubMed:文献数据库(包含200多万生物医学文献显示格式分为多种,选择MEDLINE格式可以查看数据库内部存储结构)关键字[TI]:定位关键字一级核苷酸数据库NCBI(GenBank):隶属于美国国立卫生研究院(NIH)结构:EMBL(ENA):欧洲核苷酸序列数据集DDBJ:日本DNA数据库Ensembl

2020-07-29 20:56:00 1247

空空如也

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