IMvigor210数据集下载踩坑 R Studio

R Studio(R Version 4.3 )中手动安装两个包 ：

安装前记得使用BiocManager安装一些依赖包：比如

if(!requireNamespace("BiocManager",quietly = TRUE))
  install.packages("BiocManager")
BiocManager::install(c("biomaRt",
                       "circlize",
                       "ComplexHeatmap",
                       "corrplot",
                       "DESeq2",
                       "dplyr",
                       "DT",
                       "edgeR",
                       "ggplot2",
                       "limma",
                       "lsmeans",
                       "reshape2",
                       "spatstat",
                       "survival",
                       "plyr")) 

注意下面顺序，不要安装反了

1.手动安装 DESeq包(注意，DESeq版本一定是1.39.0，其他版本不能用)，
地址如下：
https://www.bioconductor.org/packages/3.11/bioc/html/DESeq.html
如下图选择，下载下来，在R Studio 中手动安装。

2.手动安装IMvigor210CoreBiologies.tar.gz包
地址如下：
http://research-pub.gene.com/IMvigor210CoreBiologies/IMvigor210CoreBiologies.tar.gz

安装好之后，
library(“IMvigor210CoreBiologies”)
data(cds)
不再报错。
接下来数据读取，处理部分代码请参考：
https://mp.weixin.qq.com/s/e2lYFBijDKeoryOgS3UhLw

提示：报错“退出状态不为0”，一般为版本问题