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转载 ggplot2画热图展示相关系数
df<-read.csv("dataset1.csv",header = T,row.names = 1)dfdf1<-cor(qwe)#注意:每列值必须为数值#upper.tri(df1) #我们的目的:去除右上角的数值,保留左下角的数值。将右上角的内容去除。结果显示为:右上角返回true,左下角为false#df1[upper.tri(df1)]<-NA #把右上角的值赋值为none(缺失)#df1class(df1) #查看数据集的格式#df2<-as.dat
2021-04-11 10:47:19 1730
原创 关于多个变量之间来两两相关的可视化作图 R语言
install.packages("GGally")library("GGally")df<-read.csv("dataset1.csv",header = T)head(df)cols<-c("steelblue","violetred1")df$SEX<-factor(df$SEX) #如果某列为文本形式(0.1,0.2,需改为因子形式(0.1表示男,0.2表示女#p<-ggpairs(df,columns = 2:5, #画出2-5列的关系图#
2021-04-10 17:41:00 2411 1
原创 使用R语言---ggplot2包绘制富集分析气泡图
代码如下:#首先要保证自己已经安装了可以读取.xlsx的包#library(readxl)qwe<-read.xlsx("file.xlsx")#file就是你的文件夹的名。注意路径要正确#library(ggplot2)pathway = read_xlsx("file.xlsx") p = ggplot(pathway,aes(Pvalue,Pathway)) #读取文件中的数据,横坐标数据为Pvalue,纵坐标数据为Pathway#p=p + geom_point() p
2021-03-02 20:44:27 2863 9
空空如也
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