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原创 linux批量下载基因组、基因序列、基因组注释信息

输入参数为：python3 down.py -i list -o .，-i参数为你想要下载的accession_number号，-o参数为输出路径；ncbi虽然有提供专门的下载的方式，但是比较复杂，如果想知道怎么下载的，可以私聊我。我这里所提供的是我改过的，可以更加方便，快捷；话不多说，批量下载开始！需要先用conda安装一个 datasets软件，然后就可以使用咯。

2024-04-08 09:57:30 210

原创用primer3批量设计引物

不过，在这之前要先保证python里有pandas、primer3-py和biopython这3个包。运行命令为：python3 primer.py {详细引物文件} {引物文件}primer3有提供批量设计引物的方法，话不多说，直接放脚本！

2024-03-18 10:28:05 688

这个包提供根据assession number来批量下载多条序列，如果各位想知道具体用法，可以--h看看功能，我这里就不具体阐述；ncbi虽然有提供批量下载蛋白序列和基因序列的方法，但是一次性最多好像只能下载300条序列，，但是对于我们生信分析来说，有点不够用了，因为平时可能需要下载几百、上千条序列；这就是批量下载基因序列和蛋白序列得方法了，如果有啥问题，可以留言，我会及时回复得！如果去ncbi下载，得下到猴年马月去，所以果断使用python脚本来获取；我们这里可以看到总共需要300多万的序列；

2023-11-28 10:51:40 1662