- 博客(19)
- 问答 (1)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 单细胞入门（1）——介绍
单细胞转录组测序流程包括原始数据处理、表达矩阵获取、细胞质控过滤、降维聚类、细胞类型注释等关键步骤，通过分析细胞特异性基因表达谱揭示复杂生物系统的细胞异质性。文章详细介绍了35个常用单细胞数据库资源，如CellMarker、PanglaoDB等，涵盖人类和小鼠多组织细胞标记物、肿瘤免疫、发育轨迹等功能注释，为单细胞研究提供重要数据支持。这些数据库整合了数百万单细胞数据，可用于细胞类型鉴定、差异基因分析和功能状态研究。
2025-07-12 21:26:56
1280
原创 2025河南高考生物真题及解析
本文摘要：本研究探讨了生物学多个领域的核心问题，包括细胞结构、遗传机制、生态关系和生物技术应用。研究显示最小基因组细胞必须含有核糖体（A），T2噬菌体元素S完全来自宿主（B），水通道蛋白不结合水分子（B错误）。生态调查表明积水频次影响生态系统稳定性（C正确），但水涝是非密度制约因素（D错误）。实验验证了肿瘤细胞通过体液而非突触传递信息（组二），并发现引入天敌（B曲线）可控制烟粉虱种群（生物防治）。遗传分析确定紧凑株型由a基因控制（插入序列致翻译终止），通过PCR和电泳验证基因型。微生物筛选获得高活性卡拉胶酶
2025-07-11 21:03:22
2031
原创 科研绘图——2.韦恩图（venn）
韦恩图是一种通过交叠圆形展示集合关系的可视化工具，不同颜色代表不同集合，重叠部分表示共同元素。它适用于少量（通常≤4个）集合的简单关系展示，但存在元素数量表达不精确、不适用连续数据等局限。R语言提供多种绘制方法：VennDiagram包支持高定制化输出，ggvenn/ggVennDiagram包与ggplot2兼容，eulerr包适合精确比例展示。对于更复杂（＞4组）的数据关系，推荐使用UpSet图，其通过矩阵和条形图组合能更清晰展示多组交集情况。在线工具如jvenn也可快速生成基础韦恩图。
2025-07-10 20:15:00
1175
原创 单细胞入门（2）-经典案例分析
摘要： 本文详细介绍了使用Seurat包进行单细胞RNA-seq数据分析的完整流程。从数据预处理（包括读取10X Genomics数据、质控过滤、标准化、高变基因筛选），到细胞亚群分析（PCA降维、UMAP/tSNE可视化、聚类分析），再到差异基因表达分析和细胞类型注释。重点展示了如何利用QC指标筛选细胞、选择合适的PCA维度、进行细胞聚类以及识别细胞类型特异性标记基因。最后通过已知标记基因将无监督聚类结果与已知细胞类型匹配，完成细胞类型注释。整个分析流程采用R语言实现，并提供了关键参数设置说明和可视化方法
2025-07-09 22:35:27
1608
5
原创 科研绘图——1.小提琴图（Violin Plot）
小提琴图是箱型图与核密度图的结合，能同时展示数据的统计特征和概率密度分布。其核心元素包括四分位数范围、中位数、最大最小值以及反映数据密度的宽度。相比箱型图，小提琴图的优势在于能呈现多模态数据的整体分布形态。通过R语言的ggplot2包可以绘制多种形式的小提琴图，包括基础图、分组图（单变量/双变量分组）、分面图以及组合图（结合箱线图和散点）。内置数据集如iris和diamonds常用于演示，通过调整颜色、透明度等参数可优化可视化效果。小提琴图特别适合展示不同类别下连续变量的分布差异。
2025-07-08 20:00:00
3680
原创 R语言入门与数据分析（1）
R语言数据类型与操作指南摘要 本文系统介绍了R语言中的核心数据类型及其操作方式，主要包括： 基础数据类型：数值型、字符型、逻辑型和日期型 数据结构：详细讲解了向量、矩阵、数组、列表、数据框和因子的创建与操作方法 数据处理技巧：包括向量运算、索引、缺失值处理(NA/NaN/Inf)、字符串操作和时间序列分析 实用功能：工作目录设置、文件操作、变量管理和历史记录查看 常见错误提示：特别强调了赋值符号、字符串引号、函数括号等易错点 文章还提供了数据框操作、因子创建、矩阵运算等实用范例，并总结了R语言操作中的10个
2025-07-07 20:00:00
2009
原创 2024高考生物真题及解析
1.大豆是我国重要的粮食作物。下列叙述错误的是( )A.含有不饱和脂肪酸，熔点较低，室温时呈液态B.大豆的蛋白质、脂肪和淀粉可在人体内分解产生能量C.大豆中的蛋白质含有人体细胞不能合成的D.大豆中的脂肪和磷脂均含有碳、氢、氧、磷4种元素【答案】D。大豆元素组成：C、H、O、N四种。A植物大多数是含不饱和脂肪酸，室温液态；动物大多含饱和脂肪酸，室温为固态。B蛋白质、脂肪和淀粉均可在人体内分解产生能量。必需氨基酸人体不能合成只能从外界摄取。2.干旱缺水条件下，植物可通过减小气孔开度减少水分散失。
2025-04-10 13:23:05
1248
原创 实战1——芯片数据挖掘
Mengual L, Burset M, Ars E, Lozano JJ, Villavicencio H, Ribal MJ, Alcaraz A. DNA microarray expression profiling of bladder cancer allows identification of noninvasive diagnostic markers. J Urol. 2009 Aug;
2025-04-08 17:17:44
559
原创 0.基本环境配置、数据库介绍
这些都可以用group_by()结合，允许“按组”执行任何操作。dplyr 旨在抽象数据的存储方式。这意味着除了使用本地数据框外，还可以使用完全相同的 R 代码处理远程数据库表。而在数据处理，尤其是数据框处理的过程中，dplyr是必学的R包之一。处理上述功能之外，
2025-04-08 17:16:17
1272
原创 2-转录组测序分析（1）
①测序数据下载（SRA Toolkit）；②测序数据质控与过滤（fastp）；③序列比对（SAMtools、HISAT2）；④序列组装（StringTie、TACO）；⑤表达定量和差异表达分析（Salmon、DESeq2）及富集分析（clusterProfiler）等。
2025-04-03 19:50:09
778
空空如也
conda 安装时报错，求大神看一下啥情况
2021-06-16
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人