可以用于GO,KEGG,GSEA的分析
##GO ##KEGG ##GSEA
#安装R包:方法1:
install.packages(‘BiocManager’)
#安装R包:方法2:
if(!requireNamespace(“BiocManager”, quietly = T))
install.packages(“BiocManager”)
BiocManager::install(“topGO”)
好啦,下面的R包就都可以安装上啦!
library(openxlsx)#读取.xlsx文件
library(ggplot2)#柱状图和点状图
library(stringr)#基因ID转换
library(enrichplot)#GO,KEGG,GSEA
library(clusterProfiler)#GO,KEGG,GSEA
library(GOplot)#弦图,弦表图,系统聚类图
library(DOSE)
library(ggnewscale)
library(topGO)#绘制通路网络图
library(circlize)#绘制富集分析圈图
library(ComplexHeatmap)#绘制图例