10X单细胞目前大多数公司基本和高级分析汇总

本文详细介绍了单细胞测序数据的常用分析步骤,包括细胞聚类、可视化、差异分析、批次效应消除、轨迹分析、细胞互作、周期分析、相关性分析以及WGCNA和CNV分析,旨在帮助研究人员完善数据处理流程。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

这次我们客套话就不讲了,直接上干货

列表汇总

我们来逐步看看(质控部分)

细胞聚类及可视化

样本/cluster差异分析

批次效应去除

细胞定义

Marker基因展示

拟时分析(轨迹分析)

细胞互作

细胞周期分析

单细胞bulk相关性分析

功能富集

WGCNA

CNV分析

基本涵盖了单细胞频率比较高的分析内容,大家查漏补缺就好

生活很好,等你超越

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