今日课题---人类胰腺癌中特异性KRAS突变体的不同临床结果和生物学特征(空间 + 突变)

作者,Evil Genius
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今日参考文献

知识积累
  • KRAS突变在胰腺导管腺癌(PDAC)中具有不同的致癌性
  • KRAS^{G12R}突变在早期(I期)疾病中富集。
  • KRAS^{G12D}相比,KRAS^{G12R}肿瘤与远处复发减少和生存率提高相关。
北京知识
  • 有四个主要的驱动基因-KRAS, TP53, SMAD4和CDKN2A-驱动胰腺肿瘤的发生,驱动基因的改变与pdac患者的预后相关。
  • KRAS^{G12D}突变(35%的患者)与非KRAS^{G12D}突变(单独或与TP53突变联合)相比,生存率更差。
  • 最近的一项研究表明,与TP53突变的其他KRAS等位基因相比,KRAS^{G12D}和TP53共突变可提高总生存率。这些相互矛盾的发现提出了驱动基因的改变是否会影响生存的问题。
  • KRAS^{G12D}中KRAS信号和上皮-间质转化(EMT)的复发性富集以及KRAS^{G12R}中肿瘤坏死因子(TNF)/核因子kB (NF-kB)信号的复发性富集。
结果1、早期PDAC的独特临床特征
  • 主要关注I期和II-III期的区别

     

结果2、特定的基因组特征与早期PDAC相关
  • KRAS在361例(90%)患者中发生突变,TP53在284例(71%)患者中发生突变,CDKN2A在95例(24%)患者中发生突变,SMAD4在68例(17%)患者中发生突变。
  • 与晚期肿瘤患者相比,早期肿瘤患者更有可能在BRAF和TGFBR2中发生推定的致癌突变。
  • 在早期和晚期肿瘤之间的突变总数没有显著差异。
  • KRAS^{G12D}突变145例(36.5%),KRAS^{G12V}突变129例(32.5%),KRAS^{G12R}突变55例(13.9%),其他KRAS突变32例(8.1%),KRAS野生型(WT) 36例(9.1%)。
  • 相对于晚期疾病,KRAS^{G12R}在早期PDAC中富集
  • KRAS^{G12V}、其他KRAS突变和KRAS^{WT}在早期或晚期疾病中均不富集
  • 尽管KRAS^{G12D}突变型疾病在早期和晚期肿瘤中同样丰富,但与KRAS^{G12D}或其他KRAS突变相比,KRAS^{G12R}突变的患者更有可能处于早期阶段。

结果3、KRAS^{G12R}突变型PDAC具有明显的临床特征
  • 原发肿瘤的大小差异仅限于KRAS^{WT}肿瘤,KRAS^{WT}肿瘤往往更小。
  • KRAS^{G12R}肿瘤更常为淋巴结阴性。此外,KRAS^{G12R} PDAC患者更有可能有胰腺癌家族史。
  • KRAS^{G12R}与淋巴结阴性病理的频率增加有关。

结果4、KRAS^{G12R}突变体PDAC特征为肿瘤抑制基因失活增加
  • KRAS^{G12R}突变肿瘤的CDKN2A突变比例高于KRAS^{G12D}
  • KRAS^{G12R}突变肿瘤在KRAS、CDKN2A和SMAD4的各种组合的频率上是不同的,两种或多种肿瘤抑制因子(TP53、SMAD4和CDKN2A)的改变比KRAS^{G12D}突变更常见。
结果5、KRAS^{G12R}突变体PDAC的预后改善
  • KRAS^{G12D}突变患者相比,KRAS^{G12R}突变患者似乎具有不同的首次复发模式。
  • 在复发时间分析中,与KRAS^{G12D}相比,KRAS^{G12R}疾病、KRAS^{WT}疾病和其他KRAS突变的远处复发率较低。相反,KRAS^{G12R}疾病的局部复发率升高。
  • 关于肿瘤抑制因子,我们也能够发现与野生型相比,TP53突变与更差的OS相关。

     

结果6、KRAS^{G12R}KRAS^{G12V}在外部数据集中与生存率的提高有关
  • KRAS^{G12D}患者的总生存期比KRAS^{G12V}KRAS^{G12R}KRAS^{WT}患者短。
  • 没有肿瘤抑制基因突变的患者比那些至少有一个TP53、CDKN2A或SMAD4共突变的患者有更长的生存期

     

结果7、空间分析鉴定KRAS^{G12R}KRAS^{G12D} PDAC之间的等位基因特异性差异
  • KRAS^{G12R}KRAS^{G12D}在肿瘤部分的差异大于微环境中细胞类型的差异。
  • 进行邻域分析,以确定样本中的“niche”。

     

结果8、KRAS^{G12R}在人和小鼠PDAC中表现出较弱的恶性特征。

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