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原创 柱状图+散点+误差棒(errorbar)+差异显著性检验(Python或者R语言)(T检验&F检验)(原理+代码)跟着子刊学配色

虽然还是有5%机会出错(1-0.05=5%),但我们还是可以「比较有信心」的说:目前样本中这情况(两地土壤pH差异 情况)不是巧合,是具统计学意义的,「总体中没差别」的虚无假设应予拒绝,简言之,总体应该存在著差异。2.加误差棒和差异显著性检验差不多,因为取平均或者中值画出的柱状图太过于泛化,忽略了很多影响(比如我的处理中,平均值画出的柱状图差距很大,但是通过统计检验发现差异不显著,这可能受到极差等的影响)两地土壤的pH均数并不相同,但这差别是否能推论至总体,代表总体的情况也是存在著差异呢?

2024-07-15 16:24:11 1013

原创 不同处理的土壤样本的各功能群落的香农指数(Shannon)和辛普森指数(Simpson)的计算(Python)

香农指数(Shannon Index),也称为香农多样性指数(Shannon Diversity Index),是用来衡量群落中物种多样性的一种指数。它考虑了物种的丰富度(即物种数量)和均匀度(即各物种的相对丰度)。辛普森指数(Simpson Index)也是用来衡量群落多样性的指标,但它更侧重于描述物种的优势度。- 如果群落中所有物种的个体数量都非常均匀,则辛普森多样性指数接近于0。- 辛普森指数可以用来衡量群落中物种的均匀度,指数越高表示均匀度越高。- 如果某个物种非常占优势,香农指数较低。

2024-07-03 14:59:47 1355

原创 百分比堆积柱状图(R语言)跟子刊学配色

数据结构如下,绘制百分比堆积柱状图。

2024-07-02 16:21:40 191

原创 相关性热图绘制及配色方案(更新)(Python)

微生物属与环境因子之间的相关性绘图。

2024-07-01 16:10:33 582

原创 生态位宽度计算&可视化展示(R语言)

物种的生态位越宽,该物种的特化程度就越小,倾向于泛化种(generalist species);物种的生态位越窄,倾向于是一个特化种(specialists species)。生态位宽度是指物种(或其它生物单位)在群落中所利用的各种不同资源的总和。本篇所使用为生态位宽度指数即**Levins的生态位宽度指数。

2024-06-30 16:00:09 596

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