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RSS订阅原创 生信学习-高通量分析-NMDS分析: 非度量多维尺度分析
NMDS分析: 非度量多维尺度分析（Non-metric multidimensional scaling,NMDS）是一种将多维空间的研究对象简化到低维空间进行定位，分析和归类，同时又保留对象间原始关系的数据分析方法。一般用组间样本的秩次（数据排名rank order）上的差异来定义距离。NMDS图形常用作微生物群落研究的β分析。NMDS侧重反映距离矩阵中数值的排序关系，弱化数值的绝对差异程度。在多样本、物种数量多的情况下（相对于数值间的差异，可进行排序的数量更大），NMDS模型能更准确地反映出距离矩
2021-02-26 15:12:20
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原创 生信学习-代谢组检测 分析之 PLS-DA
代谢组检测 分析之 PLS-DA偏最小二乘判别分析（Partial least squares Discriminant Analysis， PLS-DA）偏最小二乘法判别分析是一种用于判别分析的多变量统计分析方法。判别分析是一种根据观察或测量到的若干变量值，来判断研究对象如何分类的常用统计分析方法。其原理是对不同处理样本（如观测样本、对照样本）的特性分别进行训练，产生训练集，并检验训练集的可信度。PLS-DA是一种有监督的判别分析统计方法。可以PLS-DA建立代谢物表达量与样品类别之间
2021-01-06 10:51:45
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原创 生信学习-高通量分析-MDS
生信学习-高通量分析-MDS多维尺度变换（multidimensional scaling，MDS）MDS与PCA非常相似，都是一种降维的方法。MDS分为度量MDS（Metric Multidimensional scaling）和非度量MDS（Non-metric Multidimensional scaling）。其中非度量MDS也称为经典（Classical）MDS，也叫做主坐标分析（principal coordinate analysis,PCoA）。对样本为高维数据的点，且均为数值，则
2020-12-22 15:28:07
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空空如也
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