生信学习-高通量分析-MDS

最新推荐文章于 2024-04-09 10:36:25 发布
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生信学习-高通量分析-MDS

多维尺度变换（multidimensional scaling，MDS）
MDS与PCA非常相似，都是一种降维的方法。
MDS分为度量MDS（Metric Multidimensional scaling）和非度量MDS（Non-metric Multidimensional scaling）。
其中非度量MDS也称为经典（Classical）MDS，也叫做主坐标分析（principal coordinate analysis,PCoA）。

对样本为高维数据的点，且均为数值，则可以通过MDS 方法对样本降维到2，然后绘制在图上，并且将不同的聚类用颜色区分开。如此，可以获得比较直观的，聚类结果。

示例图片: 在这里插入图片描述MDS of microbial profiles showing humanized mice (in halos) reflecting the individual features of their
respective human donors (arrows)

言早
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