433、最小基因变化——BFS

一、题目描述

433、最小基因变化

基因序列可以表示为一条由 8 个字符组成的字符串，其中每个字符都是 'A'、'C'、'G' 和 'T' 之一。
假设我们需要调查从基因序列 start 变为 end 所发生的基因变化。一次基因变化就意味着这个基因序列中的一个字符发生了变化。
    ● 例如，"AACCGGTT" --> "AACCGGTA" 就是一次基因变化。
另有一个基因库 bank 记录了所有有效的基因变化，只有基因库中的基因才是有效的基因序列。
给你两个基因序列 start 和 end ，以及一个基因库 bank ，请你找出并返回能够使 start 变化为 end 所需的最少变化次数。如果无法完成此基因变化，返回 -1 。
注意：起始基因序列 start 默认是有效的，但是它并不一定会出现在基因库中。

示例：
输入：start = "AACCGGTT", end = "AAACGGTA",
bank = ["AACCGGTA","AACCGCTA","AAACGGTA"]
输出：2

二、分析与思路

    今天的每日一题是广度优先搜索的知识，但是对这些知识点并不熟悉，只是知道要用到 队列 的知识，因此又是抄官方题解、理解官方题解的一天；

    变化规则：给定一个字符串 start ，每次只能改变一个字符得到一个新的字符串 next ；这个最字符串只有在字符串库 bank 里面才算一个合法的字符串；并且每个变化字符只能 A’, ‘C’, ‘G’, ‘T’ 中进行选择；这里的字符串也就是题目中提到的基因序列。

根据以上变化规则，我们可以进行尝试所有合法的基因变化，并找到最小的变化次数；
    （1）如果 start 与 end 相等，此时直接返回 0；如果最终的基因序列不在 bank 中，则此时按照题意要求，无法生成，直接返回 -1 ；
    （2）首先我们将可能变换的基因 s 从队列中取出，按照上述的变换规则，尝试所有可能的变化后的基因，比如一个 $\text{AACCGGTA}$，我们依次尝试改变基因 s 的一个字符，并尝试所有可能的基因变化序列 $s_0,s_1,s_2,\cdots ,s_i,\cdots ,s_{23}$，变化一次最多可能会生成 $3\times 8=24$ 种不同的基因序列；
    （3）我们需要检测当前生成的基因序列的合法性 $s_i$，首先利用哈希表检测 $s_i$ 是否在数组 $\text{bank}$ 中，如果是则认为该基因合法，否则把非法直接丢弃；其次我们还需要用哈希表记录已经遍历过的基因序列，如果该基因序列已经遍历过，则此时直接跳过；如果是合法且未遍历过的基因序列，那么我们将其加入到队列中；
    （4）如果当前变换后的基因序列与 $\text{end}$ 相等，此时我们直接返回最小的变化次数即可；如果队列中所有的元素都已经遍历完成还无法变成 $\text{end}$ ，此时无法实现目标变化，返回 $-1$。

三、代码实现

class Solution {
public:
    int minMutation(string start, string end, vector<string>& bank) {
        unordered_set<string> cnt, visited;
        char keys[4] = {'A', 'T', 'C', 'G'};

        for(auto &str : bank){
            cnt.insert(str);
        }
        // 去除一些特殊情况
        if(start == end){					// (1)
            return 0;
        }
        if(cnt.count(end) == 0){
            return -1;
        }
        queue<string> q;
        q.push(start);
        visited.insert(start);
        int step = 1;

        while(!q.empty()){
            int sz = q.size();
            int i, j, k;
            for(i = 0; i < sz; ++i){		 // (2)
                string now = q.front();
                q.pop();
                for(j = 0; j < 8; ++j){
                    for(k = 0; k < 4; ++k){
                        if(keys[k] != now[j]){
                            string next = now;
                            next[j] = keys[k];
                            if(!visited.count(next) && cnt.count(next)){  // (3)
                                if(next == end){						  // (4)
                                    return step;
                                }
                                q.push(next);
                                visited.insert(next);
                            }
                        }
                    }
                }
            }
            ++step;
        }
        return -1;
    }
};

四、总结

    （1）广度优先搜索，一般用来求解 树的层序遍历问题、最短路问题、连通性问题、拓扑排序，这也是接下来的学习重点。后序继续更新；
    （2）$\text{set}$ 的插入操作是 emplace() 或者 insert() 。注意对于 $\text{set}$ 中的 count() 命令的使用。

五、参考资料

1、最小基因变化-官方题解；