基于R语言BIOMOD2模型的物种分布模拟

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随着生物多样性全球大会的举办，不论是管理机构及科研单位、高校都在积极准备，根据国家林草局最新工作指示，我国将积极整合、优化自然保护地，加快推进国家公园体制试点，构建以国家公园为主体的自然保护地体系。针对我国目前已有自然保护区普遍存在保护目标不明确、保护成效低下和保护空缺依然存在等问题，科学的鉴定生物多样性热点保护区域与保护空缺显得刻不容缓。

BIOMOD2提供运行多达10余种物种分布模拟模型，模拟特定物种与其环境之间的关系，试图利用环境变量来模拟特定物种的生态位

专题一：BIOMOD2模型概述

R平台下软件包的安装

软件包的功能、模型介绍

物种分布的基本原理

物种分布模型的发展、种类及评价方法

影响物种分布模型准确性的因素

专题二：BIOMOD2模型运行

2.1物种分布文件的建立

数据获取的途径与方法

物种分布的确认与筛选

数据文件的格式

2.2环境变量的选择

环境变量获取的途径与方法

环境变量的选择及处理方法

图层处理

2.3 模型参数及其设置

模型的训练、检验

权重设置

Pseudo-absences数据及设置

2.4 模型算法介绍及主要参数

模型包括： GLM、GBM、GAM、CTA、ANN、SRE、FDA、MARS、RF和MAXENT.Phillips

专题三：BIOMOD2模型运行结果的分析与解释

模型效果的评估

变量的贡献（重要性）

响应曲线

专题四：BIOMOD2模型的预测及分析

未来气候变化下的情景预测

物种适生区的变化、转化率等

MESS分析过程及实现

专题五：BIOMOD2模型的应用案例

基于单个模型算法（MAXENT）的案例

基于组合预测模型的应用案例