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原创 使用GCTA软件进行GWAS

备注:genotype为二进制基因型文件,无需后缀,--make-grm-alg为 1 表示___,为 0 表示___。(3)协变量文件:前两列为Family ID和Individual ID,后面为协变量(固定效应等:如性别、年龄、PCA)(2)表型文件:3列。准备:将基因型和表型文件复制到GCTA软件的对应文件夹下,在路径输入cmd,进入命令行。(3)分析:mlma为输出格式,thread-num为线程数,输出名称为trait1。(1)基因型文件:ped、map或二进制fam、bim、bed文件。

2023-04-25 21:58:07 1770

原创 GWAS丨GEMMA软件下载和安装

GWAS丨GEMMA软件下载和安装

2023-02-26 21:56:27 3305 1

原创 BGLR包——基因组选择

BGLR: '贝叶斯广义线性回归'

2023-02-26 21:22:27 1732

原创 np.logspace() — 对数等比数列

np.logspace( ) — 对数等比数列

2023-02-24 17:21:13 999 1

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