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原创 蛋白质结构的测定与理论预测

冷冻电子显微镜解析蛋白质三维结构方法的优点是可直接获得生物大分子在接近胜利条件下的结构及构象变化、无需结晶、所需样本量相对较少、研究对象广泛,适合解析大分子复合物(分子量大于80kDa的蛋白质、病毒及复合物)的三维精细结构,且样品分子量越大、对称性越高,越容易区分异质性,从而越容易获得高分辨率结构,此外,冷冻电镜技术已经将生物大分子复合物的结构解析能力拓展至原子分辨率水平,在膜蛋白结构解析和小分子药物及疫苗的开发中显露出巨大的潜力。③可测定蛋白质可变形的尾部的构象,它往往和蛋白质的活性功能紧密相关;

2024-07-26 00:06:33 242

原创 蛋白质结构预测与分析

超二级结构世界语蛋白质二级结构与三级结构之间的蛋白质结构层次,超二级结构是指有蛋白质分子中若干相邻的二级结构原件组合在一起,彼此相互作用,排列形成规则的、在空间上能够辨认的二级结构组合,在多种蛋白质中充当三级结构的构件(buliding block),其基本形式有αα、ββ、βαβ等。结构域是指在超二级结构上形成的三级结构的局部折叠区,它是相对独立的紧密球状实体,是蛋白质多肽链中具有特异结构和独立功能的区域,能自稳定,独立于其他区域折叠,其构成蛋白质三级结构的基本单元,通常由50~300个氨基酸残基组成。

2024-07-24 23:47:11 695

原创 Pytorch总览及学习方法

啥叫反向自动微分,简单来讲就好比磁带录音机能录制完成的操作并进行回放,这样的话调试就简单了,并且能够很好地适应某些应用程序,比如动态神经网络,因为神经网络需要不断的迭代。Pytorch是一种用于构建深度学习模型的功能完备框架,主要是用来图像识别和语言处理等应用程序的机器学习。Pytorch是一种开源深度学习框架,以出色的灵活性和易用性著称。Pytorch还有一个优势是快速原型设计和小型项目,因为代码简洁,易上手和灵活性所以深受学术界和研究界喜爱。社区,这是一个充满活力的大型社区,具有优秀的文档和教程。

2023-04-23 18:04:47 156 1

空空如也

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