sbatch脚本命令提交出现问题(Can not append to buffer file in /tmp)

-------问题------ 

提交命令脚本后,记录脚本出现如下报错

-------问题分析------  

根据提示:

  • GNU Parallel 使用 /tmp 目录作为缓冲区来存储并行任务的输出,这个错误表明无法向 /tmp 目录中的缓冲文件追加内容。

推荐解决方法:

  • 检查磁盘空间:使用 df -h 命令来检查 /tmp 目录所在分区的磁盘空间使用情况。

  • 清理磁盘空间:如果磁盘已满,删除不必要的文件或移动文件到其他存储设备上,以释放空间。

  • 更改临时目录:设置 $TMPDIR 环境变量或使用 --tmpdir 选项来指定一个有足够空间的临时目录。

  • 使用压缩:使用 --compress 选项来减少输出文件的大小。

  • 检查任务输出:如果任务输出非常大,考虑是否有必要重定向输出到文件,或者是否可以减少输出量。

  • 检查任务逻辑:确保并行任务的逻辑没有问题,不会意外地产生大量输出。

  • 资源监控:在执行并行任务时,监控系统资源的使用情况,确保不会因资源耗尽而导致任务失败。

 -------问题解决------  

1. 将原脚本中,请求的4 个核心的计算资源改为2个;

2. 将一次提交命令的个数从3个改为1个。

-------内容补充-----

检查 /tmp 目录所在分区的磁盘空间使用情况:

# 显示/tmp目录所在分区的磁盘使用情况
# -h表示使用人类可读的格式显示(如K、M、G)
df -h /tmp 

# 显示系统中内存的使用情况,包括已用内存、空闲内存、缓存(buffer)等
free -h

# 查看内存分配的详细信息,包括各种大小的内存块的使用情况
cat /proc/buddyinfo

# 显示系统中的进程和资源使用情况动态的实时视图,包括缓存和缓冲区的使用
top

 

  • 5
    点赞
  • 5
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 0
    评论
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值