sbatch提交作业

sbatch

创建一个待运行的脚本保存为su.sh

#!/bin/bash
/usr/local/bin/Rscript ~/XXX_.R > XXX.out

使用sbatch提交到计算节点

sbatch -N 2 -p c-4-1 -n 8 -c 1 su.sh

sbatch命令的一些常用选项:

参数 功能
-N 申请的节点数量
-p 指定计算节点规格,使用sinfo查看所支持的规格
-n 指定任务数,即并行程序运行多少个进程
-c 每进程使用的cpu核心数
-q 指定队列类型,列如:-q eco 指定使用经济型队列,如果队列未开启经济型,则启动标准型
查看SLURM集群正在运行的作业;

提交示例:

使用2个4核心节点启动8个并行任务。
sbatch -N 2 -p c-4-1 -n 8 -c 1 demo.sh

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