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原创 基因组survey
jellyfish count -C -m 21 -t 3 -s 500M -o genomesurvey/kmer_count.jf il_1_clean.fq il_2_clean.fq#这里注意双端测序需要用-C参数,-m 较小基因组推荐使用17,较大基因组推荐使用21,-s。./gce -g 3295248520 -f ara.kmer.freq.stat.2colum >gce.table 2>gce.log#使用之前的得到的-g和-f参数进行基因组survey,纯合模式。
2024-01-09 11:28:20 991
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