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再次打开moe，拖入刚刚准备好的moe文件>Compute>Site>all atoms>Ligand 更改为MDB文件选择之前做好的mdb>Refinement行中poses列指输出的构象个数>run。File > import > "找到单个sdf文件>OK“or“ 将文件置于一个文件夹下 > Add All >OK”File > "选择一个希望放的地址" > 于“enter file”栏中输入新数据库的名称 > OK。如下图中的7-12列。待计算完成后>File>Save>挑选路径填写名称>ok。
2023-08-24 23:43:13
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原创 Autodock的基本使用步骤
3>Ligand-->Torsion Tree--> Detect Root 以及Ligand-->Torsion Tree--> Choose Torsion 检查配体分子的所有扭转键，方便之后查找配体的不同构象。3>鼠标左键进行旋转，右键进行移动，滑轮进行缩放。Docking-->Output-->Lamarckian GA 4.2,,-->定义dpf文件名，作为对接结果的保存文件。3>选择Edit-->Hydrogens-->Add-->OK 对残基加上H原子。
2023-07-23 19:29:37
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空空如也
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