MOE虚拟筛选步骤一览

本文介绍了如何在MolecularOperatingEnvironment(Moe)软件中建立新数据库,导入小分子文件,进行预处理(清洗和能量最小化),以及执行虚拟筛选的过程,包括Docking参数和Fingerprint计算步骤。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

一,建立一个新数据库

 File > "选择一个希望放的地址" > 于“enter file”栏中输入新数据库的名称 > OK

二,导入小分子文件

File > import > "找到单个sdf文件>OK“or“ 将文件置于一个文件夹下 > Add All >OK”

三,小分子预处理

Compute > Molecule >Wash>完成后再点Molecule> Energy Minimize > "于moe的主窗口点SVL可以看具体情况“

四,虚拟筛选

将我们的Pr.moe蛋白直接拖入moe主窗口>dock>选中pocket.ph4文件,然后run>完成之后在小分子界面>compute>fringerprint>calculate>选中fringerprint的第一个选项然后点ok>compute>fringerprint>search>设置大于60>save>保存到文件夹中

(相应参数如下图)

dock参数
calculate参数
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