一,建立一个新数据库
File > "选择一个希望放的地址" > 于“enter file”栏中输入新数据库的名称 > OK
二,导入小分子文件
File > import > "找到单个sdf文件>OK“or“ 将文件置于一个文件夹下 > Add All >OK”
三,小分子预处理
Compute > Molecule >Wash>完成后再点Molecule> Energy Minimize > "于moe的主窗口点SVL可以看具体情况“
四,虚拟筛选
将我们的Pr.moe蛋白直接拖入moe主窗口>dock>选中pocket.ph4文件,然后run>完成之后在小分子界面>compute>fringerprint>calculate>选中fringerprint的第一个选项然后点ok>compute>fringerprint>search>设置大于60>save>保存到文件夹中
(相应参数如下图)

