第44讲：玩转土壤数据！用机器学习挖掘地球皮肤的秘密 [特殊字符][特殊字符]

目录

🪨 一、为什么要对土壤做机器学习建模？

🧱 二、案例：预测土壤有机碳含量（SOC）

🌾 数据来源：

🤖 三、建模流程 Step-by-Step

1️⃣ 数据预处理

2️⃣ 特征工程与建模（Random Forest）

🧪 四、模型评估与空间预测

🧮 拆分训练测试集：

🗺️ 五、扩展：基于遥感的空间预测图

💡 六、延伸阅读与技巧

📦 七、总结：从土壤数据，到科学洞见！

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导语：
土壤，地球的皮肤，它藏着气候变化的线索、作物丰产的密码，也是碳循环的核心载体。今天，我们不搞玄学——咱们用机器学习（ML），给“土壤说话”的机会，看看数据能告诉我们什么。

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🪨 一、为什么要对土壤做机器学习建模？

你有没有遇到过这些问题：

• 为什么两块田地施一样的肥，却长得差距很大？

• 盐渍土中，哪些指标最影响有机碳？

• 怎么通过已有土样数据预测某区域未采样地块的属性？

传统土壤调查靠经验、插值、统计回归，而机器学习（ML），能处理非线性关系、变量交互、海量数据，为我们提供智能建模的新视角。

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🧱 二、案例：预测土壤有机碳含量（SOC）

我们以“预测土壤有机碳含量（SOC）”为例，做一次完整实战。

🌾 数据来源：

• 土壤采样数据（地点、深度、有机碳等）

• 环境因子：NDVI、DEM、气温、降水、土地利用类型等

# 示例数据结构（R语言）
str(soil_data)

## 'data.frame':	500 obs. of  8 variables:
##  $ SOC     : num  
##  $ NDVI    : num  
##  $ Elev    : num  
##  $ Rain    : num  
##  $ Temp    : num  
##  $ LU_type : Factor w/ 5 levels "forest","cropland",... 
##  $ lon     : num  
##  $ lat     : num

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🤖 三、建模流程 Step-by-Step

1️⃣ 数据预处理

library(tidyverse)
soil_data <- soil_data %>%
  drop_na() %>%
  mutate(LU_type = as.factor(LU_type))

2️⃣ 特征工程与建模（Random Forest）

library(randomForest)
set.seed(123)

rf_model <- randomForest(SOC ~ ., data = soil_data[, -c(7,8)], ntree=500, importance=TRUE)
print(rf_model)

🌟 重要变量可视化：

varImpPlot(rf_model)

你可能会发现：NDVI、降水、土地类型是预测SOC的关键因子！

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🧪 四、模型评估与空间预测

🧮 拆分训练测试集：

library(caret)
set.seed(42)
split <- createDataPartition(soil_data$SOC, p = 0.8, list = FALSE)
train <- soil_data[split, ]
test  <- soil_data[-split, ]

rf <- randomForest(SOC ~ ., data = train[, -c(7,8)])
pred <- predict(rf, newdata = test)

RMSE <- sqrt(mean((pred - test$SOC)^2))
R2 <- cor(pred, test$SOC)^2

cat("模型性能：RMSE =", round(RMSE, 2), "; R² =", round(R2, 2))

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🗺️ 五、扩展：基于遥感的空间预测图

你还可以结合 raster 包或 terra 包，对遥感图层进行预测，绘出SOC空间分布图！

library(raster)
stacked_env <- stack("NDVI.tif", "Rain.tif", "Temp.tif", "LU_type.tif")
names(stacked_env) <- c("NDVI", "Rain", "Temp", "LU_type")

pred_map <- predict(stacked_env, rf_model, progress='text')
plot(pred_map, main="预测SOC空间分布图")

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💡 六、延伸阅读与技巧

模型推荐	优点	工具包
Random Forest	抗噪强、变量重要性明显	randomForest
XGBoost	表现优越、可调参数丰富	xgboost
Support Vector	小数据集强大表现	e1071
神经网络（MLP）	可建更复杂关系	nnet, keras

你还可以：

• 使用 贝叶斯建模 加入不确定性；

• 构建 土壤数字孪生 模型，辅助模拟与预测；

• 与空间聚类结合，探索土壤类型与环境因子的内在关系。

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📦 七、总结：从土壤数据，到科学洞见！

在这篇分享中，我们：

✅ 理解了为什么土壤建模值得做
✅ 完成了一个完整的 SOC 预测建模流程
✅ 实现了从点数据到空间预测图的跨越
✅ 初窥机器学习与农业环境科学融合的威力

土壤并不沉默，它有它的语言。机器学习，正是你与它对话的桥梁。

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