集群上作业提交系统LSF和PBS的使用与简介

LSF作业提交系统

bsub：作业提交

通用方法

#BSUB -n num
#BSUB -l nodes=1:ppn=1
#BSUB -q queue
#BSUB -o path
#BSUB -e errorPath
#BSUB -J jobName
#BSU -I 

-n：指定num为计算核心数
-q：指定queue队列
-o：将标准输出重定向到path
-e：将标准错误信息重定向到errorPath
-J：指定jobName为作业名称
-I：交互模式

bkill：删除作业

删除作业12345：
bkill 12345

bjobs：查看作业

bqueues：查看队列信息

PBS作业提交系统

PBS是一个作业调度系统，常用于分布式高性能计算集群的作业管理。

qsub：作业提交

通用方法

在集群上使用qsub run.pbs提交作业，run.pbs一般包括这些信息：

#PBS -N jobName
#PBS -l nodes=1:ppn=1
#PBS -q queue
#PBS -o path
#PBS -e errorPath
#PBS -l walltime=800:00:00

cd  ./home/myJob
./job

-N：指定jobName为作业名
-l：用来定义资源列表，nodes=1指定该作业运行的节点数量为1，ppn=1指定每个节点需要1个cpu。walltime指定作业运行时间，800：00：00代表800个小时。
-q：指定queue队列
-o：将标准输出重定向到path
-e：将标准错误信息重定向到errorPath
最后两行是进入作业目录并执行该作业

qdel：删除作业

删除作业12345：
qdel 12345

强制删除作业12345：
qdel -p 12345

15s后删除作业12345：
qdel -W 15 12345

qstat：显示作业状态

查看所有作业：
qstat -q
查看作业12345：
qstat -f 12345

pbsnodes：显示集群中所有节点信息

查看闲置节点：
pbsnodes -l free