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RSS订阅原创 GATK best practices对variation（only for SNPs and Indels)的鉴定以及对上游数据对处理
借助网上的图用下，表表意思（只需要看图和粗体字，小字不用注意）：看完图来说话，其实你看我这篇文章，目的就是想看gatk best practices 分析的全过程,按先后顺序，给你好看。预处理过程，开始于raw data,可以上fq，也可以上uBAM，并最终产生一个用于call variantion 的bam文件。预处理过程是纠正技术带来的偏差，使数据更适用于变异检
2016-05-24 15:40:56
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原创 随机提取fq文件中的reads perl程序处理
比如我测了500X，分析后，我想看一下低深度数据的分析效果。从原fq数据中提取200X数据，也就是提取原数据量的0.4倍。辣么，我就写了个小程序。
2016-05-12 15:20:56
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空空如也
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