【算法】JAVA算法库

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分类专栏：算法仓数据结构与算法文章标签：算法机器学习 java

于 2023-06-09 11:48:53 首次发布

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一，java算法库总结表格

java算法库列举
库/框架	丰富程度	支持的算法	特点	CPU/GPU	学习成本	依赖冗余	行业应用	优点	缺点	发展前景
Mahout	中等	推荐、聚类、分类等	分布式机器学习算法	可在CPU上运行，不支持GPU加速	中等	依赖较少	推荐系统、大数据分析等领域	提供了分布式机器学习算法和工具	不支持深度学习算法	发展较慢，社区活跃度相对较低
Hadoop MLlib	高	分类、回归、聚类等	分布式机器学习算法	可在CPU上运行，不支持GPU加速	中等	依赖较少	大数据分析等领域	提供了丰富的分布式机器学习算法	不支持深度学习算法	发展前景看好
FlinkML	高	分类、回归、聚类等	流式和批量机器学习算法	可在CPU上运行，不支持GPU加速	中等	依赖较少	金融、电信等领域	流式计算能力强	不支持深度学习算法	发展前景看好
Colt	高	数值计算、线性代数等	提供各种数学、统计和矩阵运算功能	可在CPU上运行，不支持GPU加速	简单	依赖较少	科学计算、统计分析等领域	提供了丰富的数学和统计算法，性能优越	不支持机器学习和深度学习算法	稳定发展，持续维护
Coffee	高	深度学习	提供了深度学习算法和工具	可在CPU上运行，不支持GPU加速	高	依赖较少	图像识别、自然语言处理等领域	支持多种深度学习算法，使用方便，支持Keras模型的迁移	社区活跃度相对较低	新兴框架，发展前景未知
Tensor Flow4j	高	深度学习	提供了深度学习算法和工具	可在CPU和GPU上运行	较高	依赖较少	图像识别、自然语言处理等领域	强大的生态系统，广泛应用	对于初学者来说较为复杂	以人工智能为核心的发展前景广阔
DL4J	高	深度学习	提供了深度学习算法和工具	可在CPU和GPU上运行	较高	需要安装依赖库	图像识别、自然语言处理等领域	强大的生态系统，广泛应用	对于初学者来说较为复杂	增长迅速，前景看好
Apache Commons Math	中等	数值分析、线性代数、统计等	提供各种数学算法和工具，包括插值、积分、矩阵运算等	可在CPU上运行，不支持GPU加速	容易	依赖冗余	科学计算、数据分析、金融等领域	提供了广泛的数学算法和工具，文档丰富	不支持机器学习和深度学习算法	稳定发展，持续维护
Smile	高	分类、回归、聚类等	提供各种机器学习算法	可在CPU上运行，不支持GPU加速	简单	依赖较少	数据挖掘、模式识别等领域	简洁易用，性能较好	不支持深度学习算法	稳定发展，社区活跃
Weka	高	机器学习	提供各种机器学习算法，包括分类、回归、聚类等	可在CPU上运行，不支持GPU加速	中等	依赖冗余	数据挖掘、模式识别等领域	提供了丰富的机器学习算法和工具，易于使用	不支持深度学习算法	成熟稳定，广泛应用
H2O	高	机器学习	提供了丰富的机器学习算法和自动化特征工程	可在CPU上运行，不支持GPU加速	中等	依赖较少	金融、电信等领域	分布式处理能力强，提供了自动化特征工程的功能	不支持深度学习算法	发展前景看好
Deep learning4j	高	深度学习	提供了深度学习算法和工具	可在CPU和GPU上运行	高	依赖冗余	图像识别、自然语言处理等领域	支持分布式训练和推理，与Hadoop、Spark等框架集成	对于初学者来说较为复杂	增长迅速，前景看

二，代码举例

1、Mahout 示例代码：

这段代码展示了 Mahout 库中实现基于用户的推荐的方法，使用的数据集是电影评分数据集。

import org.apache.mahout.cf.taste.common.TasteException;
import org.apache.mahout.cf.taste.impl.model.file.FileDataModel;
import org.apache.mahout.cf.taste.impl.neighborhood.NearestNUserNeighborhood;
import org.apache.mahout.cf.taste.impl.recommender.GenericUserBasedRecommender;
import org.apache.mahout.cf.taste.impl.similarity.PearsonCorrelationSimilarity;
import org.apache.mahout.cf.taste.model.DataModel;
import org.apache.mahout.cf.taste.neighborhood.UserNeighborhood;
import org.apache.mahout.cf.taste.recommender.RecommendedItem;
import org.apache.mahout.cf.taste.recommender.UserBasedRecommender;
import org.apache.mahout.cf.taste.similarity.UserSimilarity;

import java.io.File;
import java.io.IOException;
import java.util.List;

public class MahoutDemo {
    public static void main(String[] args) throws IOException, TasteException {
        DataModel model = new FileDataModel(new File("data/movies.csv"));
        UserSimilarity similarity = new PearsonCorrelationSimilarity(model);
        UserNeighborhood neighborhood = new NearestNUserNeighborhood(2, similarity, model);
        UserBasedRecommender recommender = new GenericUserBasedRecommender(model, neighborhood, similarity);
        List<RecommendedItem> recommendations = recommender.recommend(1, 3);
        for (RecommendedItem recommendation : recommendations) {
            System.out.println(recommendation);
        }
    }
}

2、Hadoop MLlib 示例代码：

这段代码展示了使用 Hadoop MLlib 库实现 K-Means 聚类的方法，使用的数据集是一个三维数据点的集合。

import org.apache.spark.SparkConf;
import org.apache.spark.api.java.JavaRDD;
import org.apache.spark.api.java.JavaSparkContext;
import org.apache.spark.mllib.clustering.KMeans;
import org.apache.spark.mllib.clustering.KMeansModel;
import org.apache.spark.mllib.linalg.Vector;
import org.apache.spark.mllib.linalg.Vectors;

public class MLlibDemo {
    public static void main(String[] args) {
        SparkConf conf = new SparkConf().setAppName("KMeansExample").setMaster("local");
        JavaSparkContext sc = new JavaSparkContext(conf);

        // Load and parse data
        String path = "data/kmeans_data.txt";
        JavaRDD<String> data = sc.textFile(path);
        JavaRDD<Vector> parsedData = data.map(s -> {
            String[] sarray = s.split(" ");
            double[] values = new double[sarray.length];
            for (int i = 0; i < sarray.length; i++) {
                values[i] = Double.parseDouble(sarray[i]);
            }
            return Vectors.dense(values);
        });
        parsedData.cache();

        // Cluster the data into two classes using KMeans
        int numClusters = 2;
        int numIterations = 20;
        KMeansModel clusters = KMeans.train(parsedData.rdd(), numClusters, numIterations);

        // Evaluate clustering by computing Within Set Sum of Squared Errors
        double WSSSE = clusters.computeCost(parsedData.rdd());
        System.out.println("Within Set Sum of Squared Errors = " + WSSSE);

        // Save and load model
        clusters.save(sc.sc(), "data/KMeansModel");
        KMeansModel sameModel = KMeansModel.load(sc.sc(), "data/KMeansModel");
    }
}

3、FlinkML 示例代码：

这段代码展示了使用 FlinkML 库实现 K-Means 聚类的方法，使用的数据集同样是一个三维数据点的集合。

import org.apache.flink.api.java.ExecutionEnvironment;
import org.apache.flink.api.java.io.CsvReader;
import org.apache.flink.api.java.tuple.Tuple2;
import org.apache.flink.ml.clustering.KMeans;
import org.apache.flink.ml.common.LabeledVector;
import org.apache.flink.ml.math.DenseVector;
import org.apache.flink.ml.math.Vector;

public class FlinkMLDemo {
    public static void main(String[] args) throws Exception {
        ExecutionEnvironment env = ExecutionEnvironment.getExecutionEnvironment();

        CsvReader csvReader = env.readCsvFile("data/kmeans_data.txt")
                .fieldDelimiter(" ")
                .ignoreComments("%")
                .includeFields(false, false, true);

        KMeans kMeans = new KMeans()
                .setK(2)
                .setMaxIterations(20);

        LabeledVector[] points = csvReader
                .map(tuple -> new Tuple2<>((double) tuple.f0, (double) tuple.f1))
                .map(tuple -> new LabeledVector(tuple.f0, DenseVector.of(tuple.f1)))
                .collect()
                .toArray(new LabeledVector[0]);

        Vector[] centers = kMeans.fit(points).centroids();

        for (Vector center : centers) {
            System.out.println(center);
        }
    }
}

4、Colt 示例代码：

这段代码展示了使用 Colt 库中的矩阵运算和向量运算功能，分别进行了两个矩阵的矩阵乘法和一个向量的平方操作。

import cern.colt.list.DoubleArrayList;
import cern.colt.list.IntArrayList;
import cern.colt.matrix.DoubleFactory2D;
import cern.colt.matrix.DoubleMatrix2D;
import cern.jet.math.Functions;

public class ColtDemo {
    public static void main(String[] args) {
        DoubleArrayList x = new DoubleArrayList(new double[]{1, 2, 3});
        DoubleArrayList y = new DoubleArrayList(new double[]{4, 5, 6});

        DoubleMatrix2D a = DoubleFactory2D.dense.make(new double[][]{{1, 2}, {3, 4}});
        DoubleMatrix2D b = DoubleFactory2D.dense.make(new double[][]{{5, 6}, {7, 8}});

        DoubleMatrix2D c = a.zMult(b, null);

        System.out.println(c);

        DoubleArrayList z = new DoubleArrayList(new double[]{1, 2, 3, 4, 5});
        IntArrayList index = new IntArrayList(new int[]{0, 2, 4});

        z.viewSelection(index).assign(Functions.square);

        System.out.println(z);
    }
}

5、Coffee 示例代码：

这段代码展示了使用 Coffee 库中的逻辑回归算法对鸢尾花数据集进行分类的方法。

import com.alibaba.alink.operator.batch.classification.LogisticRegressionTrainBatchOp;
import com.alibaba.alink.operator.batch.source.CsvSourceBatchOp;
import com.alibaba.alink.pipeline.Pipeline;
import com.alibaba.alink.pipeline.classification.LogisticRegression;
import com.alibaba.alink.pipeline.dataproc.vector.VectorAssembler;

public class CoffeeDemo {
    public static void main(String[] args) throws Exception {
        CsvSourceBatchOp source = new CsvSourceBatchOp()
                .setFilePath("data/iris.csv")
                .setFieldDelimiter(",");

        VectorAssembler assembler = new VectorAssembler()
                .setSelectedCols(new String[]{"sepal_length", "sepal_width", "petal_length", "petal_width"})
                .setOutputCol("features");

        LogisticRegressionTrainBatchOp lr = new LogisticRegressionTrainBatchOp()
                .setLabelCol("class")
                .setFeatureCols("features")
                .setEpsilon(0.001)
                .setWithIntercept(true);

        Pipeline pipeline = new Pipeline().add(assembler).add(lr);
        pipeline.fit(source).transform(source).print();
    }
}

6、TensorFlow4j示例代码

这段代码展示了如何使用 TensorFlow Java API 创建一个简单的计算图，并输出一个字符串常量节点的值。

import org.tensorflow.Graph;
import org.tensorflow.Session;
import org.tensorflow.Tensor;

public class TensorFlowJavaDemo {
    public static void main(String[] args) {
        try (Graph graph = new Graph()) {
            // 创建计算图
            final String value = "Hello, TensorFlow!";
            try (Tensor<String> tensor = Tensor.create(value.getBytes())) {
                // 在计算图中定义输入节点
                graph.opBuilder("Const", "MyConst").setAttr("dtype", tensor.dataType()).setAttr("value", tensor).build();
            }

            // 创建会话并运行计算图
            try (Session session = new Session(graph)) {
                try (Tensor<?> output = session.runner().fetch("MyConst").run().get(0)) {
                    // 获取输出节点的值
                    byte[] bytes = new byte[(int) output.numBytes()];
                    output.copyTo(bytes);
                    System.out.println(new String(bytes));
                }
            }
        }
    }
}

7、DL4J 示例代码：

这段代码展示了使用 DL4J（Deeplearning4j）库实现一个简单的多层感知器（MLP）模型，对 MNIST 数据集进行手写数字分类。

import org.deeplearning4j.datasets.iterator.impl.MnistDataSetIterator;
import org.deeplearning4j.nn.api.OptimizationAlgorithm;
import org.deeplearning4j.nn.conf.MultiLayerConfiguration;
import org.deeplearning4j.nn.conf.NeuralNetConfiguration;
import org.deeplearning4j.nn.conf.layers.DenseLayer;
import org.deeplearning4j.nn.conf.layers.OutputLayer;
import org.deeplearning4j.nn.weights.WeightInit;
import org.deeplearning4j.optimize.listeners.ScoreIterationListener;
import org.nd4j.linalg.activations.Activation;
import org.nd4j.linalg.dataset.DataSet;
import org.nd4j.linalg.dataset.api.iterator.DataSetIterator;
import org.nd4j.linalg.lossfunctions.LossFunctions;

public class DL4JDemo {
    public static void main(String[] args) throws Exception {
        int batchSize = 64;
        int numClasses = 10;
        int numEpochs = 10;

        DataSetIterator mnistTrain = new MnistDataSetIterator(batchSize, true, 12345);
        DataSetIterator mnistTest = new MnistDataSetIterator(batchSize, false, 12345);

        MultiLayerConfiguration conf = new NeuralNetConfiguration.Builder()
                .seed(12345)
                .optimizationAlgo(OptimizationAlgorithm.STOCHASTIC_GRADIENT_DESCENT)
                .weightInit(WeightInit.XAVIER)
                .list()
                .layer(0, new DenseLayer.Builder()
                        .nIn(784)
                        .nOut(256)
                        .activation(Activation.RELU)
                        .build())
                .layer(1, new OutputLayer.Builder(LossFunctions.LossFunction.NEGATIVELOGLIKELIHOOD)
                        .nIn(256)
                        .nOut(numClasses)
                        .activation(Activation.SOFTMAX)
                        .build())
                .build();

        org.deeplearning4j.nn.multilayer.MultiLayerNetwork model = new org.deeplearning4j.nn.multilayer.MultiLayerNetwork(conf);
        model.init();
        model.setListeners(new ScoreIterationListener(10));

        for (int i = 0; i < numEpochs; i++) {
            model.fit(mnistTrain);
        }

        org.nd4j.evaluation.classification.Evaluation evaluation = model.evaluate(mnistTest);
        System.out.println(evaluation.stats());
    }
}

8、Apache Commons Math 示例代码：

这段代码展示了使用 Apache Commons Math 库计算一组数据的均值、方差、最大值和中位数。

import org.apache.commons.math3.stat.StatUtils;
import org.apache.commons.math3.stat.descriptive.DescriptiveStatistics;

public class ApacheCommonsMathDemo {
    public static void main(String[] args) {
        double[] data = {1.2, 2.3, 0.8, 3.9, 2.1};

        double mean = StatUtils.mean(data);
        System.out.println("Mean: " + mean);

        double variance = StatUtils.variance(data);
        System.out.println("Variance: " + variance);

        double max = StatUtils.max(data);
        System.out.println("Max: " + max);

        DescriptiveStatistics stats = new DescriptiveStatistics(data);
        double median = stats.getPercentile(50);
        System.out.println("Median: " + median);
    }
}

9、Smile 示例代码：

这段代码展示了使用 Smile 库实现一个随机森林模型，对鸢尾花数据集进行分类，并对新样本进行预测。

import smile.data.AttributeDataset;
import smile.data.parser.ArffParser;
import smile.classification.RandomForest;

public class SmileDemo {
    public static void main(String[] args) throws Exception {
        ArffParser parser = new ArffParser();
        parser.setResponseIndex(4);

        AttributeDataset dataset = parser.parse("data/iris.arff");
        double[][] x = dataset.toArray(new double[dataset.size()][]);
        int[] y = dataset.toArray(new int[dataset.size()]);

        RandomForest model = new RandomForest(x, y, 100);
        int prediction = model.predict(new double[]{5.1, 3.5, 1.4, 0.2});
        System.out.println("Prediction: " + prediction);
    }
}

10、Weka 示例代码：

这段代码展示了使用 Weka 库实现一个线性回归模型，并对鸢尾花数据集进行建模和预测。

import weka.core.Instances;
import weka.core.converters.ConverterUtils.DataSource;
import weka.classifiers.functions.LinearRegression;

public class WekaDemo {
    public static void main(String[] args) throws Exception {
        DataSource source = new DataSource("data/iris.arff");
        Instances dataset = source.getDataSet();
        dataset.setClassIndex(dataset.numAttributes() - 1);

        LinearRegression model = new LinearRegression();
        model.buildClassifier(dataset);

        double[] coefficients = model.coefficients();
        System.out.println("Coefficients: ");
        for (double coefficient : coefficients) {
            System.out.println(coefficient);
        }
    }
}

11、H2O 示例代码：

这段代码展示了使用 H2O 库加载一个梯度提升模型（GBM），并对新样本进行二分类预测。

import hex.genmodel.MojoModel;
import hex.genmodel.easy.EasyPredictModelWrapper;
import hex.genmodel.easy.RowData;
import hex.genmodel.easy.prediction.BinomialModelPrediction;

public class H2ODemo {
    public static void main(String[] args) throws Exception {
        MojoModel model = MojoModel.load("data/GBM_model.zip");

        EasyPredictModelWrapper wrapper = new EasyPredictModelWrapper(model);

        RowData row = new RowData();
        row.put("sepal_length", "5.1");
        row.put("sepal_width", "3.5");
        row.put("petal_length", "1.4");
        row.put("petal_width", "0.2");

        BinomialModelPrediction prediction = wrapper.predictBinomial(row);
        System.out.println("Prediction: " + prediction.label);
    }
}

12、Deeplearning4j 示例代码：

这段代码展示了使用 Deeplearning4j 库实现一个多层感知器（MLP）模型，对鸢尾花数据集进行分类，并计算模型在测试集上的评估指标。

import org.deeplearning4j.datasets.iterator.impl.IrisDataSetIterator;
import org.deeplearning4j.eval.Evaluation;
import org.deeplearning4j.nn.api.OptimizationAlgorithm;
import org.deeplearning4j.nn.conf.MultiLayerConfiguration;
import org.deeplearning4j.nn.conf.NeuralNetConfiguration;
import org.deeplearning4j.nn.conf.layers.DenseLayer;
import org.deeplearning4j.nn.conf.layers.OutputLayer;
import org.deeplearning4j.nn.weights.WeightInit;
import org.deeplearning4j.optimize.listeners.ScoreIterationListener;
import org.nd4j.linalg.activations.Activation;
import org.nd4j.linalg.dataset.api.iterator.DataSetIterator;
import org.nd4j.linalg.dataset.api.iterator.MultipleEpochsIterator;
import org.nd4j.linalg.lossfunctions.LossFunctions;

public class Deeplearning4jDemo {
    public static void main(String[] args) {
        int batchSize = 30;
        int numClasses = 3;
        int numEpochs = 50;
        int seed = 123;

        DataSetIterator irisIterator = new IrisDataSetIterator(batchSize, true, seed);
        DataSetIterator multipleEpochsIterator = new MultipleEpochsIterator(numEpochs, irisIterator);

        MultiLayerConfiguration conf = new NeuralNetConfiguration.Builder()
                .seed(seed)
                .optimizationAlgo(OptimizationAlgorithm.STOCHASTIC_GRADIENT_DESCENT)
                .weightInit(WeightInit.XAVIER)
                .list()
                .layer(0, new DenseLayer.Builder()
                        .nIn(4)
                        .nOut(10)
                        .activation(Activation.RELU)
                        .build())
                .layer(1, new OutputLayer.Builder(LossFunctions.LossFunction.MCXENT)
                        .nIn(10)
                        .nOut(numClasses)
                        .activation(Activation.SOFTMAX)
                        .build())
                .build();

        org.deeplearning4j.nn.multilayer.MultiLayerNetwork model = new org.deeplearning4j.nn.multilayer.MultiLayerNetwork(conf);
        model.init();
        model.setListeners(new ScoreIterationListener(10));

        model.fit(multipleEpochsIterator);

        Evaluation evaluation = model.evaluate(irisIterator);
        System.out.println(evaluation.stats());
    }
}