Julia : HDF5、JLD2库、group、dataset

JLD2库中，group和dataset是什么样的安排，取决于读、写的细节。

一、准备h5材料

using H5JL;
using DelimitedFiles;
using JLD2;
csv_file = "C:\\Users\\songroom\\Desktop\\000001.XSHE.csv";
jld_file = "C:\\Users\\songroom\\Desktop\\000001.h5";

# readdlm  header=true,=>tuple
@time csv_data,~ = DelimitedFiles.readdlm(csv_file,',',header =true);
# @time :6.5 seconds

new_csv = H5JL.drop_array_null(csv_data); #不用管，去空格的
# 从csv=>h5_array
h5_data = H5JL.get_h5_array_from_csv_by_fullcode(new_csv,"000001.XSHG");
println("h5_data::$(size(h5_data))")
#@time h5_data = turn_larger(h5_data,20)

group_dataset_name1 = "1000.XSHG/000001.XSHG";
group_dataset_name2 = "1000.XSHG/000002.XSHG";
# write
@time H5JL.write_h5_data(jld_file,h5_data,group_dataset_name1) # 4.13s
@time H5JL.write_h5_data(jld_file,h5_data,group_dataset_name2) # 4.13s

好了，我们就生成了一个.h5文件。

二、测试JLD2的h5结构

jld_file = "C:\\Users\\songroom\\Desktop\\000001.h5";
if isfile(jld_file)
   f = JLD2.jldopen(jld_file, "r+")# "r+"; 
else
   f = JLD2.jldopen(jld_file, "w")# "r"; "w"=>覆盖了
end

1、判断文件中的基本属性

julia> isempty(f)
false
julia> f.writable #文件是否可“写”
true
julia> f.written
true
julia> f.compress
false
julia> f.mmaparrays
false
julia> f.n_times_opened
1

2、group名字

julia> keys(f.root_group)
1-element Array{String,1}:
 "1000.XSHG"

3、创建新group

julia> JLD2.Group(f, "1001.XSHG")
JLD2.Group
  (no datasets)

4、dataset名字

julia> datasets =  keys(f["1000.XSHG"])
2-element Array{String,1}:
 "000001.XSHG"
 "000002.XSHG"

5、dataset取值

julia> f["1000.XSHG"]["000002.XSHG"]
589680×3 Array{Float64,2}:
 0.0  0.0  0.0
 0.0  0.0  0.0
 0.0  0.0  0.0
 0.0  0.0  0.0
 0.0  0.0  0.0
 ⋮
 0.0  0.0  0.0
 0.0  0.0  0.0
 0.0  0.0  0.0
 0.0  0.0  0.0
 0.0  0.0  0.0

6、新建dataset、赋值
（1）在“1000.XSHG”下新建000003 空的dataset，但不赋值。

julia> JLD2.Group(f, "1000.XSHG/000003")# no datasets是指下面没有dataset
JLD2.Group
  (no datasets)

julia> keys(f.root_group)
1-element Array{String,1}:
 "1000.XSHG"

julia>  keys(f["1000.XSHG"])
3-element Array{String,1}:
 "000001.XSHG"
 "000002.XSHG"
 "000003"

（2）还有一种方法，新建且赋值：
这种是在老group基础，创建新dataset，并赋值。

julia> f["1000.XSHG/000004"] =4
4

julia> keys(f["1000.XSHG"]) # 查看dataset已经变化
4-element Array{String,1}:
 "000001.XSHG"
 "000002.XSHG"
 "000004"
 "000003"

注意：但不能在原有的基础进行修改！

julia> f["1000.XSHG/000004"] =5
ERROR: ArgumentError: a group or dataset named 000004 is already present within this group

（3）另一个创建：要求是新的group!

julia> JLD2.Group(f, "0004.XSHG")["stock1"] = 600
600

7、如何在老的dataset上进行修改赋值、删除dataset、group?
可惜还没实现！

这个就说明，目前阶段，dataset不能重新赋值。如果需要重新赋值，则应先把其中的数据备份下来，删除原文件，再新建！

8、keys

dataset1 = "1000.XSHG/000001.XSHG"
dataset2 = "1000.XSHG/000002.XSHG"
dataset3 = "1001.XSHG"
haskey(f.root_group, dataset1)
haskey(f.root_group, dataset2)
haskey(f.root_group, dataset3)