C-index Bootstrap

C-index,或一致性指数,是衡量生存分析中COX模型预测值与真实值区分度的指标,尤其适用于肿瘤预后模型评估。它通过比较所有样本对的预测和实际生存时间来计算,范围在0.5到1之间,值越高表示预测精度越高。Bootstrap方法可用于检验C-index的稳定性。R包Hmisc和compareC提供了计算C-index的功能。
摘要由CSDN通过智能技术生成

什么是一致性指数?

C-index,英文名全称concordance index,中文里有人翻译成一致性指数,最早是由范德堡大学(Vanderbilt University)生物统计教教授Frank E Harrell Jr 1996年提出,主要用于计算生存分析中的COX模型预测值与真实之间的区分度(discrimination),和大家熟悉的AUC其实是差不多的;在评价肿瘤患者预后模型的预测精度中用的比较多。

一般评价模型的好坏主要有两个方面,一是模型的拟合优度(Goodness of Fit),常见的评价指标主要有R方、-2logL、AIC、BIC等;

拟合优度好,说明当前数据中的信息已经被充分提取,说明模型具有代表性,但并不能说明模型⽤于预测效果就⼀定好。

另外一个是模型的预测精度,顾名思义就是模型的真实值与预测值之间差别大小,均方误差,相对误差,C-index等。在临床应用上更注重预测精度,建模的主要目的是用于预测,而C-index它就属于模型评价指标中的预测精度。

C-index计算方法

C-index的计算方法是把所研究的资料中的所有研究对象随机地两两组成对子,以生存分析为例,两个病人如果生存时间较长的一位其预测生存时间长于另一位,或预测的生存概率高的一位的生存时间长于另一位,则称之为预测结果与实际结果相符,称之为一致。

  1. 所有样本互相配对,共有N*(N-1)/2对,其中N为样本数
  2. 去除配对中两个病人都没有达到事件终点(比如死亡),或者其中的一个病人A的生存时间短于另一个病人B,然而病人A还没
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