1 SPM12安装
1.1 下载网址
1.2 安装
解压后,将文件复制到matlab安装路径中的toolbox文件夹中
我的toolbox文件夹路径为D:\Program Files\MATLAB\R2022a\toolbox
然后打开matlab,点击设置路径-添加文件夹,选择刚刚解压的spm12文件夹。
在命令行窗口中输入spm即可打开spm12。
2 CAT12安装
2.1 下载网址
CAThttps://neuro-jena.github.io/cat//
2.2 安装
解压后,将文件复制到matlab安装路径中的toolbox文件夹下spm12文件夹中toolbox文件夹里。
我的spm12文件夹中toolbox文件夹的路径为D:\Program Files\MATLAB\R2022a\toolbox\spm12-r7219\toolbox
然后打开matlab,点击设置路径-添加文件夹,选择刚刚解压的cat12文件夹。
(和上图一样)
3 CAT12颅骨剥离
(1)打开matlab,在命令行窗口中输入spm,打开spm。
(2)在toolbox中选择cat12,会打开cat12。
(3)点击segment进行分割设置。
(4)segment界面打开后,可以设置相关参数(可默认,包含配准到MNI空间),然后点击volumes选择要分割的文件。
(5)选择到nii文件所在的文件夹,点击nii文件进行选择(可多选),选择完成后点击done,选择nii文件的页面会关闭,然后点击左上角三角号运行。
(6)segment的结果文件中会出现四个文件夹label、mri、report、surf。mri文件夹中wm开头的是去颅骨、MNI配准后的文件。