matlab怎么使用 spm_vol,SPM12批量处理预处理数据

之前写过一篇https://www.jianshu.com/p/8f16cbbfd962，当时只是初步学会，还未熟练应用。

经过几次实践，现总结下通用的流程。

从一个问题出发：

问题：我想计算海马体积、内嗅皮层体积和内嗅皮层厚度等等。

思路：经调研，使用软件CAT12和FreeSurfer都可以处理，但FreeSurfer更加耗时，而且之前我也总结过CAT12与Freesurfer的对比https://github.com/Galory/daily-paper-neuroscience/blob/master/2018/08/29.md。决定选择使用CAT12。

过程：

1.先用一个人的数据保存一个对所有人的数据选择好要进行的处理，如下图：

image.png

Tips：如果下一步的数据需要用到上一步的结果，当你选择时会有一个Dependency供你选择，如下图：

image.png

2.选择File->Save batch and script来保存一个对待处理的数据通用的batch文件，如下图，我这里保存为batch.m和batch_job.m

image.png

3.编辑batch.m和batch_job.m这两个文件，使用一个循环一次性把这些数据处理完。

于是在原本的batch.m文件里，添加如下的代码实现循环：

% By - Galory Email - 996377370a@gmail.com

% List of open inputs

global sub type

% My files are named as 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 ... 24

type={'1' '2' '3' '4' '5' '6' '7' '8' '9' '10' '11' '12' '13' '14' '15' '16' '17' '18' '19' '20' '21' '22' '23' '24'};

for i=1:length(type)

sub = i;

end

解释一下，上边length(type)就是要循环的次数，之后再把原来的代码放入这个for循环中的sub = i;与e