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原创 PyMOL中使用AlphaFold的pLDDT对蛋白进行染色

B 值范围的划分可以采用以下两种模式之一:“hist”或“ramp”。'hist' 就像一个直方图(大小相等的 B 值增量导致每个 bin 中的原子数不相等)。'ramp' 作为 B 值范围的斜坡,选择的范围在每个组中提供相等数量的原子。默认工作目录是当前pdb文件所在目录,可在Pymol命令行使用pwd命令查看。red #表示pLDDT从低到高依次被染成蓝、绿、红色。help(color_b)可查看帮助文档。要实现上图的效果,将箱子数设为3。

2024-10-07 12:42:12 353

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