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原创 libsvm最新源代码（版本3.21）理解解析（一）
一、导读 SVM的理论通过吴恩达（Andrew NG）的机器学习斯坦福公开课（http://open.163.com/special/opencourse/machinelearning.html）以及一些博文都可以很好的理解了，但理解归理解，如何实现却是另一回事。LIBSVM（http://www.csie.ntu.edu.tw/~cjlin/libsvm/）是一款是应用最为广
2016-12-23 14:25:09
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原创 libsvm最新源代码（版本3.21）理解解析（三）
一、回顾 上篇博文，我们讲述了LIBSVM的SMO算法中的三个算法。本节我们介绍LIBSVM在SMO算法中使用的其他一些技巧和算法。二、Shrinking 当我们更新α向量的时候，很可能在循环中期，有相当多的α已经达到收敛，在循环的后半部分已经不再变化了。论文中详细介绍了shrinking的原理支持，当然，我们只关心结果，那就是：在整个循环中，大部分的α元素在循环后
2016-12-26 16:03:25
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原创 libsvm最新源代码（版本3.21）理解解析（二）
一、回顾 上节，我们介绍到了SMO的总体过程，本节对SMO的三个难点结合代码进行详细分析。二、SMO算法 （1）设置拉格朗日乘子α=(α[1]...α[i]...α[l])的初始值（一般设为全0），并设置迭代次数计数器k=1。 （2）如果α向量已经收敛（符合KKT达到停止条件），停止循环，返回结果；否则，找出工作集B=(i,j)，实际上
2016-12-26 09:17:15
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原创 虚拟机ubuntu集群编译安装GROMACS（MPI版本）软件过程
尝试编译安装gromacs时遇到了不少问题，记录一下：1.搭建MPI并行环境：http://blog.csdn.net/xiaoqiangqiangjie/article/details/53079181。2.阅读官方的安装手册：http://manual.gromacs.org/documentation/2016.1/install-guide/index.html。3.按照官方的
2016-11-15 19:46:57
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原创 虚拟机ubuntu14.04编译MPI版本NAMD
最近，尝试用ubuntu编译NAMD，由于以前对NAMD完全未接触过，也不懂该专业的相关知识，因此作为一个外行人尝试编译NAMD，这里记录一下粗略过程：1.首先，需要搭建MPI并行环境：http://blog.csdn.net/xiaoqiangqiangjie/article/details/53079181。2.从官网下载source code，http://www.ks.uiuc.e
2016-11-14 15:18:42
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转载 Ubuntu(14.04.1)配置MPI多机并行环境（虚拟机）详细步骤
虚拟机中配置MPI多机环境与PC中基本相同，但会有许多不同之处，连同配置时经常出现的错误和解决方法在此记录。步骤：1.准备：首先需要搭建多个虚拟机，即建立虚拟机，不同数量的虚拟机搭建过程基本相似（省略虚拟机安装步骤），同时需要保证虚拟机能上网，且能互相连通。错误常见：虚拟机不能上网，不能互相连通（ping通），除了常见的虚拟机上网方式选择错误外，还要检查是否是杀毒软件停止了虚拟机服
2016-11-08 09:44:57
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空空如也
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