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RSS订阅原创 Python生物信息学数据管理——第11、12章课后习题
10.1 计算FASTA纪录def count_number(filename): fo=open(filename,'r') count=0 for line in fo: if line[0]=='>': count+=1 return countprint(count_number('genome.fasta'...
2019-04-09 20:35:34
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原创 Python生物信息学数据管理——第9、10章课后习题
import refo=open('genome.fasta','r')#把多序列文件整成字典格式，并使序列连贯起来txt=fo.readlines()flag=Trueseq=''dict={}title='A'for line in txt: if line[0]=='>' and flag==True: title=line elif l...
2019-04-09 20:33:52
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原创 Python生物信息学数据管理——第7、8章课后习题
7.1在7.2.2的示例代码中出现的表里添加一行平均浓度或消光值并打印#添加一列平均消光值table = [ ['protein', 'ext1', 'ext2', 'ext3'], [0.16, 0.038, 0.044, 0.040], [0.33, 0.089, 0.095, 0.091], [0.66, 0.184, 0.191, 0.191], ...
2019-04-09 20:32:06
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原创 Python生物信息学数据管理——第5、6章课后习题
5.1一个简单的字典dict0={'UAA':'Stop','UAG':'Stop','UGA':'Stop','AUG':'Start','GGG':'Glycin'}5.2对起始和终止密码子进行计数rna=''for line in open('a.fasta'): if not line.startswith('>'): rna=rna+line.st...
2019-04-09 20:31:16
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原创 Python生物信息学数据管理——第3、4章课后习题
3.1读取和写入文件fo=open('neuron_data.txt','r')fi=open('neuron_data_副本.txt','w')txt=fo.read()fi.write(txt)fo.close()fi.close()3.2计算平均值和标准差import mathfo=open('neuron_data.txt','r')fi=open('结果.txt',...
2019-04-09 20:30:16
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原创 Python生物信息学数据管理——第1、2章课后习题
1.1计算所有三种组织中的ΔG值import mathdef detlaG(ATP,ADP,Pi): R=0.00831 T=298 deltaG0=-30.5 return deltaG0+R*T*math.log(ADP*Pi/ATP)print('肝中：',detlaG(3.5,1.8,5.0))print('肌肉中：',detlaG(8.0,0.9,...
2019-04-09 20:29:15
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空空如也
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